太陽逐漸西落，柯南背著書包心事重重地回到偵探事務所。
新出智明回來之後，他意外地再次發現了黑衣組織的蹤跡，跟著痕跡追查下去，發現了剛剛死去不久的電腦工程師板倉卓，對方正受組織的委托編寫一種危險的軟件。
在他的日記里，板倉卓說這款軟件危害到全人類，所以並沒有完成。板倉卓原本是打算在交貨日前離開日本，但誰知意外死亡。
發現這些信息的他欣喜之余並沒有聯系其他人，和阿笠博士兩個人悄悄地去了板倉卓的住址。那天剛好是交貨的日子，他到達住處之後搜查板倉卓屋子里的資料，還沒多久，伏特加的電話打了過來。
攫攫。他冒險用板倉卓的聲音跟對方交涉，約定凌晨四點在車站的地下室鐵櫃交貨。他試圖得到伏特加的指紋、唾液，並且在軟件盒子里裝了發信器，想要找到黑衣組織的所在地。
但誰曾想除了伏特加之外，琴酒也來了。
不同于伏特加這個粗心的大個子，琴酒的觀察能力和推理能力都是一流的，輕而易舉地就看出了他的手段，並推測放置東西的人還藏在附近。
他膽戰心驚地藏于櫃子中，听著對方一個一個打開櫃門尋找的聲音，然後因為缺乏氧氣昏了過去，直到天亮的時候被博士找到。
一晚上心驚膽戰，到頭來除了板倉卓加密的日記，再沒有收獲到有關于那個組織的有用的信息。
即使這件事情已經過去幾天，他還是有些神不思蜀。
他沒有跟灰原也沒有跟上川瞬說這件事，他不是不相信他們，而是這兩個家伙總有很多事情瞞著他。這種什麼都不知道的感覺讓他十分不好。
「我們是上帝也是魔鬼，因為我們要違逆時光的洪流，讓死者重新復蘇……」
他低聲呢喃著從日記里看到的這句話，越想越感覺冰涼，那股寒意似乎要將他整個人籠罩在其中。
「柯南！」小蘭氣叉腰呼呼地瞪他，「我都叫了你好幾次了，你在想什麼呀！」
「啊？」回過神來的柯南一臉茫然。
小蘭又重復了一遍剛才的話，「我說！明天就是空手道的比賽了，你來給我加油嗎！」
「啊？什麼時候？」柯南更茫然了，他這幾天都在想關于組織的事情，完全忘了小蘭的空手道比賽。
「就是周末啊，這次比賽京極真也會來。」
「京極真？」柯南記起這個人了，他有些疑惑，「京極真不是已經是日本空手道冠軍了嗎？干嘛還要來參加比賽？」
「他不是來比賽的，是特邀嘉賓啦。」
「這樣啊……」柯南點點頭，要是京極真也來參加比賽，那就有點欺負人了。
「我听說京極君是特意從美國回來當嘉賓的哦！」
「對哦，我記得他記得他當時和園子告白的時候說了會去美國……」柯南顯然是回憶起了當時的事情，他當時真的完全沒想到京極真居然會對園子一見鐘情，要不是園子先遇到了上川瞬，估計園子不會拒絕他。
「他該不會是為了園子回來的吧？」
小蘭就看著柯南陷入了某種沉思的狀態中，然後突然來了這麼一句。她眸光微眯，在柯南腦袋上輕輕錘了一下，生氣地道︰「什麼園子，要叫園子姐姐！」
柯南捂住腦袋干笑兩聲溜進屋里。
巘追書看。要是平常他或許會去調侃一下上川瞬，但現在實在沒那個心情。
小蘭叉腰看著柯南溜進房間，她臉上佯裝生氣的表情平緩下來，甚至帶上了點淡淡的笑意。
柯南那種下意識的反應，真是怎麼看怎麼不像小孩子呢。
…….
在快斗家做客的上川瞬打了個噴嚏，他抽了張紙，擤鼻涕。因為感冒的緣故，他整個人看起來懶洋洋的，完全沒有活力。
快斗以風一般的速度跟上川瞬拉開距離，生怕感冒病毒傳染給他，「你怎麼又感冒了呀。」
「什麼叫我又感冒了，我也沒感冒幾次好嗎？」上川瞬的聲音有些沙啞，原本只是扁桃體發炎的小感冒，結果居然發展到了流鼻涕！
「你的抵抗力不行啊。像我晚上駕駛著滑翔翼到處飛，一點事都沒有。」
「」
呵呵，你在山里飛兩三個小時試試看，不凍死你！
他是個正常人，會感冒很正常好嗎！
不跟他插科打諢，上川瞬說起正事，「白老板你還記得吧？」
「恩。」快斗正色起來。
上川瞬上次跟他說了白老板這個人後他去查過，他也模不準這個情報商人查怪盜基德是想要干什麼。趁著上川瞬拜托他幫忙，他也想去試探一下這個家伙。
「我上次拜托你幫忙的事情你可以準備了，就這幾天。」
「不拖了？」
「時間差不多了，沒必要拖了。」現在距離左輪來找他已經有一段時間了，再拖下去也沒有什麼必要。大不了就是白老板繼續試探，他拜托快斗多出場幾次。
「我仔細跟你說一下要扮演的人物的性格，遇到那個家伙時是什麼態度」
快斗快速地將上川瞬所說的內容記下，他的記憶力很好，上川瞬只需要說一遍，他就能一字不漏地記住。
听完，他驚奇地看著上川瞬，就像在干什麼稀有動物，「你們之間發生了啥？」
上川瞬簡單地跟他說了一下跟白老板的恩怨情仇，惹得快斗又是一陣驚奇。
「原來你上次受傷是因為這個！我就說你咋突然骨折了呢，還說什麼情況復雜這情況還真挺復雜的。」
「總之就是這樣，他看到你了肯定會跟上去，你就往人多的地方走，他不會在大庭廣眾下動手。」上川瞬原本是想自己上的，但是他感冒了，不是很好偽裝。他還挺怕白老板對快斗動手，以快斗的那撲克槍，肯定是打不過對方。
「反正就是露個面，讓他打消對我的懷疑就行，其他的你自己發揮吧。」
「OK！」這種小忙對快斗來說完全小意思。
上川瞬正打算走，突然想到了什麼，「有機會的話，幫我把那五十萬要回來。」