孫可望率大軍抵達大理，龍在田與許名臣當即大開城門，迎接大西軍的到來。孫可望又命劉文秀領兵征討麗江，連克鶴慶、劍川等城，麗江土司木垚開城獻降，滇西北自此平定。
孫可望隨即傳諭各地土司上繳錢糧、供給人役，哪知諭令一下，各地土司瞬間炸了鍋，紛紛抗拒大西軍的號令，負險固守，好不容易才稍稍穩定下來的局勢又變得混亂起來。孫可望發現自己失策，連忙收回諭令，然而卻是收效甚微。
就在孫可望焦頭爛額的時候，一個名叫金維新的昆明諸生上書孫可望，曰︰「學生昆明生員金維新俯伏拜叩大西國主千歲，今有滇、黔土司，受沐氏恩威三百年，故凡有征調，朝呼夕至，今若早迎沐公回省，與之共事，此方為上策。學生冒昧諫言，望千歲三思，謹此拜表以聞。」
這金維新，字公趾，平日里頗有才學，自詡是諸葛孔明般的人物。先前由于天下大亂，金維新並沒有選擇出仕，而是隱居于山林中，獨善其身。盡管如此，雲南的形勢金維新卻是洞若觀火，自從大西軍入滇後，他見大西軍軍力強盛，對百姓更是秋毫無犯，心中頗為欣喜，認為這支軍隊有別于過去那些腐敗的明朝軍隊，可堪大用，遂起了投效之意。
讀罷金維新的上書，孫可望這才猛然醒悟，自己居然把雲南最重要的精神領袖黔國公沐天波給忘了！高興之余，孫可望對金維新此人大為贊賞，更是將這個名字牢牢記在了心里。孫可望于是趕緊傳令劉文秀率軍趕赴永昌，游說沐天波與大西軍合作。
七月，劉文秀抵達永昌城下，隨即派遣使者入城，將繳獲的沐氏世代相傳寶物悉數歸還，並以「共扶明室，恢復江山」為詞，勸說沐天波與大西軍聯合，共同剿滅沙定洲殘部，抵御清軍進犯。
沐天波與沙定洲有著不共戴天之仇，這些年來，沙定洲害得他是家破人亡，流離失所。雖早存恢復之心，卻苦于自己實力有限，無法報仇。今日見大西軍兵強馬壯，劉文秀在書信中言辭態度也是十分誠懇，又想到大明江山傾頹，抗清終乃大局，遂毫不猶豫地答應了。
為表示合作的誠意，沐天波派遣世子沐忠罕代表自己前往大西軍中與劉文秀接洽，並發出檄文，責成永昌府推官署金騰道印王運開、通判署府劉廷棟向大西軍繳印投降。
不料王運開和劉廷棟二人卻是死活不肯歸降，竟捶胸頓足，號啕大哭了好一陣子。而後當場撕毀檄令，禁閉府門，拒不奉命。
無奈之下，沐天波只得請出永昌府中大小縉紳數百人前往哀請。哪知王、劉二人已是王八吃秤砣，鐵了心，不論大伙怎麼勸，皆是不肯答應。消息不脛而走，一時間，城中百姓群情激憤，洶洶咸集于府前，要求他們盡快獻印投降。見民心難違，二人走投無路，遂將大印掛于胸前，在府衙大堂上懸梁自盡，大西軍旋即佔據了永昌。
由于沐家世鎮雲南，在軍衛和土司中享有很高的威望，孫可望因此並沒有收繳沐天波那枚世代相傳的「征南將軍印」，而是讓他行文招撫各地土司。
在沐天波的號召下，順寧、蒙化、金齒等土司皆次第來歸，只有東川土司祿萬億和祿萬兆兄弟二人尚在觀望，不肯投降。
至此，雲南十八府，除蒙自、阿迷州、東川以外，盡皆平定，混亂已久的雲南局勢，終于塵埃落定。
緊接著，孫可望又選派官吏前往各地赴任，並于沿途設置馬塘，軍中、地方旦有飛報公文，一晝夜便可到達昆明。
大勢已定，孫可望于是留下都督王復臣駐守干崖、隴川一帶，自率大軍攜黔國公沐天波以及楊畏知等新附之臣，東返昆明。
回到昆明後，孫可望當即傳諭全滇，曰︰「孤率三兄弟，統百萬貔貅，平定雲貴！今建國不建統，紀年不紀號，惟願與黔國公沐氏攜手共扶明後，恢復江山！」
緊接著孫可望又重新任命了內閣及六部各級官員，在安西元帥李定國、撫南元帥劉文秀以下，仍封沐天波為黔國公，提調土漢官兵，加雲鶴服色；楊畏知為華英殿大學士兼都察院左都御史；並以嚴似祖為吏部尚書兼禮部尚書，丁序焜為戶部尚書，任僎為兵部尚書，雷躍龍為刑部尚書，王應龍為工部尚書；張虎為錦衣衛指揮使，馬兆熙為學院。
同時調整地方各級政權結構，滇黔二省的地方官皆由孫可望親自委任。鑒于雲南初定，大西軍另在貴州設立行營，分兵屯駐各地，又收編諸土司之兵數萬人，一時間大西軍兵馬強盛，精銳之兵近二十萬。
八月初，孫可望開始在昆明城中營建王府，他命人拆毀呈貢縣城磚石以為宮牆，腳寬六尺有余，並僭越使用黃瓦紅牆，殿懸五龍，陛雕盤螭。另在宮門外設通政司，立下馬牌，置天子儀仗，一切皆參照皇家標準。除此之外，還在城郊建太廟祭祀張獻忠，凡有大事必先告之于太廟。
直到這時，沐天波方才發現孫可望根本就沒把大明朝廷放在眼中，打的是扶明抗清的旗號，行的卻是割據一方之事，與沙定洲相比，竟有過之而不及。無奈黔國公府的實力經過沙定洲之亂，早已不同往日，為了不給自己招惹災禍，沐天波惟有終日閉門不出，盡量避免與孫可望走得過近，只與楊畏知經常保持書信往來，互相傾訴愁腸。
話說這日傍晚，楊畏知在府中正準備用膳，忽有太監前來傳諭，召楊畏知即刻前往王府。見太監神色匆匆，問起緣由也是答非所問，楊畏知以為是自己與沐天波暗通書信之事被孫可望察覺，心中頓時忐忑起來，連忙假裝月復中疼痛，然後飛奔至其女楊玉琴閨房之中，小聲叮囑女兒道︰「為父走後，你且速去書房，將那些往來書信盡數焚毀，不可延誤！」
這楊玉琴今年才剛滿十七，家中排行老三，自幼生得便是粉雕玉琢，加上楊畏知僅此一個女兒，更是將她奉為掌上明珠，疼愛有加。
在對女兒千叮萬囑之後，楊畏知這才稍稍安下心來，趕忙返身回到大廳，跟隨傳諭太監覲見孫可望去了。
見楊畏知到來，孫可望立刻熱情地迎上前去，一把挽住他的手，將楊畏知按坐到旁邊一張太師椅上，接著在他身旁坐定，開門見山地詢問道︰「孤听聞先生有一愛女，如今年方十七，尚待字閨中，有閉月羞花之姿，沉魚落雁之貌，不知是也不是？」
楊畏知見孫可望並不是為沐天波之事興師問罪，剛剛緊張的情緒瞬間緩和了許多，可他不知孫可望為何會突然提起自己的女兒，只能是點頭答道︰「在下確有一女。」
孫可望哈哈一笑道︰「孤向來喜好成人之美，孤之二弟安西王，今二十有七，相貌堂堂，文武雙全，孤有意為他說一回媒，從此你我兩家結成秦晉之好，共保大明江山如何？」
楊畏知心中一驚，萬萬沒想到這孫可望今日卻是為提親而來，可他分明記得定國已有妻室，若是再娶豈不是二房？且不說他們楊家乃是名門望族，對方卻是流賊草寇出身，門不當戶不對，只說自己就玉琴這麼一個女兒，好端端的卻被嫁去給人家當妾，又于心何忍？
念及至此，楊畏知趕忙婉言拒絕道︰「安西王的威名在滇中又有何人不知，可在下听聞安西王已有妻室，這……恐怕不妥。」
孫可望明白楊畏知的顧慮，不禁笑著說道︰「先生是擔心愛女不是正室，虧待了她吧！這點請先生盡管放心，孤這個弟弟乃是性情中人，不論正室還是側室定然都會一視同仁的！只要先生肯答應這門親事，孤承諾必讓定國以正室之禮，隆重迎娶貴千金，絕不讓貴千金受一點委屈！先生莫要再猶豫了，只要結了親，先生不但是大明的臣子，還是咱們大西軍安西王的岳父，如此一來，咱們兩家的聯盟也將更加牢固了！」
楊畏知低頭沉默了許久，這才說道︰「事關小女終身大事，可否容在下先回去問問小女的意思，然後再做決斷？」
孫可望立刻表示了同意︰「先生請便，孤就在此靜候佳音了！」
拜別了孫可望，楊畏知心事重重地回到府中，旋即把玉琴喊至面前。
見父親安然無恙，玉琴那顆懸著的心總算是放了下來，連忙詢問道︰「剛剛可真是嚇死女兒了，那孫將軍到底何事來找父親？」
楊畏知轉身在太師椅上坐定，端起茶杯，輕輕咂了一口茶，這才放下茶杯，和顏悅色地說道︰「玉琴啊，你的歲數也不小了，父親想和你說說終身大事。」
玉琴的臉瞬間變得緋紅，手足無措道︰「好端端的，父親為何突然說起此事？」
「不瞞你說，剛剛平東王找為父，就是為說媒而來。他想將你許配給安西王，為父平日里常听人說，這安西王素來心懷仁義，在四川時便曾多次勸阻張獻忠不要屠戮百姓。拋開過去流寇的身份，人品相貌皆屬一流，倒也與你般配，只可惜他已有妻室，讓你嫁去做個側室，卻委屈了你。」說到這里，楊畏知不禁發出了一聲嘆息。
哪知玉琴早對定國仰慕已久，今日楊畏知之言竟正中其心意，連忙勸慰道︰「父親大人莫要難過，女兒听說這安西王乃是不世而出的大英雄，能嫁給他是女兒幾輩子修來的福氣，有何委屈可言？況且依女兒看來，這安西王與平東王本不是一路人，若能借聯姻的機會將他拉攏過來，曉以忠義，豈不是一舉兩得？」
楊畏知先前並沒有想那麼多，經玉琴一提醒，不禁連連點頭，心中愁雲也在瞬間消散︰「女兒能有此想，為父很是欣慰！既然如此，我這便回復平東王，應下這門親事！」
在得到楊畏知的答復後，孫可望又找來定國，本以為定國會滿口答應，哪知他卻當場拒絕道︰「大哥萬萬不可！臣弟曾經發誓，今生只娶香蓮一人！還請大哥盡快收回成命！」
孫可望瞪大了眼楮，不可置信道︰「傻弟弟，哪個男人沒有三妻四妾？你是堂堂的安西王，娶個二房咋了？況且那楊畏知的女兒長得是花容玉貌，又是名門之後，給你做個側室，實在是便宜了你小子！還有什麼不滿足的？定國啊！定國！這門親事可沒有你想的那麼簡單！這楊畏知可是雲南官紳的領袖，只有拉攏了他，咱們才算真正在滇中立足，不會再發生當初四川士民紛叛的局面！你可知道？」
「話雖如此，可是……」情急之下，定國一時語塞，竟不知該怎麼向孫可望解釋了。
孫可望擺了擺手，將定國的話打斷，不容置疑道︰「別再可是了！正所謂長兄如父，這事就這麼定下來了！你若是不方便跟弟妹解釋，哥哥我親自幫你去說！」