三月，清軍平西王吳三桂一路大敗明軍總兵杜子香，進佔合州，並于次月攻陷重慶。
吳三桂遂以重兵鎮守重慶，嚴防夔東十三家，隨即與李國翰率軍取道綦江，于四月二十五日進逼三坡、虹關、石台關一帶。此間山高路窄，上則摩于九天，下則墜于重淵，人皆覆澀，馬皆釘掌，節節陡險，一夫可守。
明軍主將劉鎮國率軍五千及數頭戰象在此扼險堅守，卻被吳三桂一舉擊潰。旋即清軍乘勝追擊，又在開州擊退明軍總兵梁亦英，迅速佔領了三坡、遵義。
得到前線節節敗退的消息後，定國立刻命令全軍向安莊一線收縮，並往安莊派去援軍鞏固防線。
與此同時，中路清軍在洛托、洪承疇的統領下于月底抵達貴陽，大敗明軍馬進忠部，馬進忠棄城而走，貴陽旋即易手，貴州巡撫冷孟鉦被擒，不屈而死。
就在清軍步步緊逼之時，文秀的病情也愈發沉重了。由于文秀始終不肯與定國見面，無奈之下，定國只得讓金維新代自己前去探望。
金維新抵達蜀王府，在世子劉震的帶領下來到了文秀的臥室，剛一進屋就看見文秀正平躺在榻上，面容憔悴，大口地喘著粗氣，時不時還伴隨著一陣咳痰聲。
萬萬沒想到，僅僅數月不見，一向溫文儒雅的文秀竟會變成如此模樣，金維新當即泣不成聲地拜倒在地，痛心疾首地說道︰「殿下須當好自珍重身體，爭取早日康復，重返前線，帶著將士們繼續殺韃子！」
文秀勉強睜開眼楮，見是金維新，不禁一聲嘆息道︰「金先生快快請起，本王怕是大限已至，恢復大明江山的重擔，將來可就全都壓在晉王身上了！」
听文秀這麼說，金維新忍不住哽咽道︰「如今山河破碎至此，殿下怎可舍我等而去？切莫再胡思亂想，您正值壯年，必定能夠康復起來！」
文秀卻是艱難地擺了擺手，強撐起一抹笑意︰「本王的身體，本王自己清楚。吾已是病入膏肓，難以周全，怕是要先走一步，在地下等著晉王克復中原的喜訊了。」
話說到此，文秀已是上氣不接下氣，一旁的御醫見狀連忙走上前來，對著金維新施禮道︰「金大人請回吧，蜀王殿下需要休息了。」
金維新剛剛從座椅上起身，卻見文秀伸手指向窗台旁的桌案，小聲說道︰「金先生，勞煩將本王放在桌上的奏折交給皇上。」
等金維新將奏折收好，文秀方才繼續說道︰「本王還想再見一見二哥。」
「殿下稍等片刻，在下這就去請晉王過來！」金維新發現文秀氣若游絲，知道他怕是挨不過今日了，連忙轉身快步離開蜀王府，飛身上馬直奔晉王府，將文秀的情況一五一十地稟報給了定國。
定國聞訊大吃一驚，知道文秀命不久矣，這是要交代後事了，心中大慟，趕緊喊來香蓮，翻身躍上「二斗金」，載著她飛馳趕到了蜀王府。
進門見到文秀這般情景，香蓮忍不住失聲大哭道︰「哥，這才幾個月不見，你到底是怎麼了？」
定國強忍著淚水，緊緊攥住文秀冰涼的手︰「三弟，你我兄弟剛剛割襟結盟，可不能就這樣棄我而去啊！」
听到定國和香蓮的呼喊，文秀艱難地睜開眼楮，微微抬了抬手，示意旁邊的人全都退下，並帶上了房門。
直到這時，文秀方才緩緩言道︰「二哥、小妹，你們可算來了！這幾日，每我當閉上眼，腦海中浮現的全都是咱們兄妹三人小時候在一起的美好時光，可如今卻是恍若隔世！若有來生，咱們還做兄妹！」
文秀的話讓定國的淚水瞬間如決堤的洪水，一發不可收拾，只見定國垂淚言道︰「三弟，都怪哥哥猜忌過重，使你傷心至此，是哥哥對不住你！你且多多保重身體，待大病痊愈之時，咱們兄弟再一起上陣，與韃子決一死戰，以報國仇家恨！」
「二哥莫要安慰于吾，吾自隨義父舉事以來，早就料到會有這麼一天，一切都是命數使然，二哥、小妹不必如此悲傷！待吾死以後，大明朝就只剩下二哥你一人獨木支撐了，望二哥多多保重身體，不要步吾之後塵。」文秀輕輕拍了拍定國的手背，滿臉的不舍和留戀。
定國早已泣不成聲︰「想當年，咱們兄弟四人共同入滇，如今四弟戰死，大哥降清，僅剩下你我兄弟二人唇齒相依，本該同舟共濟，可哥哥卻這般猜忌于你，真是悔不當初啊！」
提起孫可望，文秀心中頓時充滿了懊惱，長嘆一聲道道︰「如今大哥已是形同陌路，對你我二人更是恨之入骨。吾其實從沒想過要取他的性命，只希望他能夠痛改前非，可沒想到大哥居然選擇降清，當年義父正是死于韃子之手，大哥今日卻認賊作父，此舉必遭天譴矣！」
定國正欲開口說話，卻被文秀把話打斷，垂淚言道︰「二哥，今日之難皆因大哥引狼入室所致，清軍如今從陝西、湖南、兩廣三路同時進攻，我軍危矣！愚弟已是力不從心，二哥務必要想出退敵之策，否則社稷毀壞，亡國滅種，皆我兄弟之過也！」
定國點頭安慰道︰「三弟，哥哥我哪怕只剩一口氣在，也斷然不會讓滿韃子輕易得逞！你病得如此之重，卻還為國事操心，哥哥我實在是肝腸寸斷啊！」
文秀說了這麼久話，早已是精疲力盡，只見他強撐著一口氣艱難地繼續托付道︰「我命不久矣，二哥還須親自前往貴陽督軍，否則貴陽陷落，滇都亦不能獨存！此外還應當派一員上將提一支勁旅，聯合夔東十三家鎮守四川，決不能讓清軍輕易從漢中南下入川！只有全力經營四川，將此做為他日北進中原的根基，大明復興方有指望！待我死後，愚弟家眷盡皆托付二哥了，尤其是犬子劉震不才，還須勞煩二哥教導成人，早日為國效力。」
定國難過地點了點頭︰「為兄知道了，你就放心吧。」
文秀于是拼盡全身最後的力氣，緊緊拉住定國的手，高呼一聲︰「收復河山……」旋即，永遠閉上了眼楮。
永歷十二年四月二十五日，一代名將劉文秀于滇都病逝，縱觀他的一生，早年追隨張獻忠轉戰南北，後歸附大明，忠心報國，功勛卓著，可惜時運不濟，空有一身本事，卻始終沒能得到施展的機會。
定國握著文秀的手，久久不肯松開，直到手心得溫度漸漸變得冰涼，腦海中不停浮現起當年的金戈鐵馬，回想起兄弟四人當年談笑風生的情景，如今就只剩下自己一人苦苦獨撐危局。
臨終之前，文秀曾上遺表雲︰「虜兵日逼，國勢日危，請入蜀以就十三家之兵。臣有窖金一十六萬，可以充餉。臣之妻子族屬皆當執鞭弭以從王事。然後出營陝、洛，庶幾轉敗為功。此臣區區之心，死而猶視者也。「
永歷帝在看完文秀遺疏之後，心中不禁感慨萬千道︰「蜀王于病危之時，對江山社稷依舊縈繞于心，不但捐贈其全部積蓄窖金，更是號召子孫盡忠報國，共赴國難，可謂肝膽可昭日月，真乃忠勇之士也！」
定國听了永歷帝之言，亦是心中羞愧，後悔當初猜忌之心，深感文秀胸懷坦蕩，感慨言道︰「蜀王乃真英雄也！吾自愧不如，請皇上治罪。」
永歷帝對于文秀的死訊也是悲慟不已，更是輟朝三日，謚曰:「忠」字，葬于安寧曹溪寺右山。
經過秦王之亂，蜀王病故這一系列打擊，永歷朝中人心惶惶，愈發死氣沉沉，望著文秀的棺槨入土，定國更是心如潮涌，一種不祥之感瞬間蔓延遍全身。
五月初二日，孫可望在麻勒吉等的護送下來到了北京城，順治帝命和碩簡親王濟度、和碩安親王岳樂帶領公、侯、伯、梅勒章京、侍郎等大批高官顯爵出城相迎，場面隆重異常。
圍觀人群中，有萬歷朝戶部主事方大鉉之子，南直隸桐城大族子弟方文正在其中，他親眼看到孫可望竟得到了清廷如此厚待，忍不住賦詩言道︰「南海降王款北庭，路人爭擁看其形。紫貂白馬蒼顏者，曾攪中原是殺星。」
次日，順治帝親自于太和殿召見孫可望，並在十天之內賜宴多達三次，賜銀兩次共一萬二千兩，此外賜府第、賜蟒袍、朝衣、緞匹等不可計數。
一時間，孫可望竟從喪家之犬一躍成為清廷中紅極一時的大人物，這令孫可望不禁誠惶誠恐，受寵若驚。念及八年前自己舉雲南全省之地向漂泊動蕩的主動示好，永歷君臣卻連一個秦王的封爵都是百般刁難，心中更是唏噓不已，感慨良多。
當月，吳三桂又于開州擊敗了明軍楊武部，水西、酉陽、藺州諸府全部淪陷。
六月十九日，坐鎮滇都的定國在金維新的陪同下登上滇西雞足山進香。
賓川雞足山，蒼崖萬仞，翠微千里，猿踞揉攀，高峻險拔，定國登上雞足山，被其美景陶醉其間，不禁流連忘返。就在此時，附近石鐘寺方丈行遠大師率僧眾迎出寺門，畢恭畢敬地說道︰「老衲不知晉王駕臨，未曾遠迎接，請晉王治罪！」
定國連忙上前，恭恭敬敬地作揖言道︰「方丈客氣了，您是有福之人，在此山之中修煉，真是恍若仙境！」
行遠大師連忙接過話題，笑著說道︰「舊聞晉王盡忠報國，素有善緣，今日一見果然名不虛傳。」
定國在行遠大師的陪同下步入石鐘寺，環顧一眼四周，忍不住感慨道︰「此寺看來已年久失修了！」
行遠大師無奈地說道︰「鄙寺也曾打算修葺，奈何多年戰亂不息，徭役賦稅繁重，實在是力不從心也！」
定國听後，沉默了許久，待至進香完畢，方才讓行遠大師取來筆墨紙硯，當場發布諭令道︰「晉王李令諭︰照得雞足名山，滇西形勝，本藩西征既捷，便道進香，蓬麓躋巔，游覽已悉。惟是峰壑幽深，剎院不無傾圮，詢之僧眾，咸稱近苦差徭。因念其供奉香燈，出于常住，寺僧別無活計，雜派宜于從寬；即或增加田糧，有司當為減豁。至于本山度牒，援納已經通免，自後或有奸胥、積棍，播害滋端，過往官兵，搜求踐踏，許爾各寺僧人，指名啟究，永為遵守，俱勿違！此諭。」
至七月，卓布泰一路清軍，則自黎平攻入了貴州獨山，至此，清軍三路大軍盡皆集結于貴州，準備大舉進犯雲南。