第四道命令就是編制的正規化。實際上編制的正規化早就已經提上日程了，並做好了前期鋪墊工作。到現在為止只差一個正式命令。從這道命令下發之日起，劉佩的家丁們就正式分為陸軍和海軍兩部分，並且掛在了總參謀部下面。
不過劉佩在海外的軍隊完全正規化，而留在大名境內的實行兩套軍制。也就是說明面上依然按照大明的軍制來稱呼自己，實際上已經改變了。不過留在大明境內的幾千人都是經過考驗的忠誠手下，不擔心有泄漏的問題。即便是泄露出去劉佩也有話說，畢竟他這是他私人的家丁，而不是大明的軍隊。
隨著劉佩一連串命令的簽發，他所有的麾下機構都開始緩緩的運行，向磨合機器一樣咬合的越來越緊密，全力以赴的奔著下一場戰爭開始準備。
這也是劉佩最無可奈何的地方！本來隨著時間的推移，劉佩的實力會越來越強。但是隨著第二艦隊越來越龐大。現在已經有點兒掩藏不住了！作為一支艦隊。為了保證戰斗力必須要出海訓練。而日益龐大的艦隊無論怎麼樣隱藏，終究會有蛛絲馬跡落在海面上。
現在已經有海上傳說，說有奇怪的西洋大夾板船在海面上出沒。只是沒人把這件事情當真事而已。但是等到今年年底的時候，第二艦隊就會變成一支接近30艘戰艦的龐大艦隊！這麼大的艦隊根本藏不住的！所以劉佩必須在自己的實力徹底暴露之前徹底打垮鄭芝龍。
這段時間內，隨著海上戰事的平息，各方的貿易更加興盛了。由于海上少了不少船只。海上的船只反而更加緊俏。但是明眼人都知道，現在只不過是戰前的平靜而已。
就在這個時候，劉佩之下的秋收到來了。對這次秋收劉佩異常重視！他不僅把自己的侍衛打散了分派到各地看情況，還有親自到下面視察。
在視察過程中，他還帶上夫人王雅。不得不說，王雅果然是大家閨秀出身，做起事情來極有手段。
劉佩和王雅成婚之後，劉佩交給夫人一件事情做。那就是經常要去關懷一下那些孤兒們。一方面，劉佩覺得這些孩子確實需要有女性的關心。另一方面，他認為王雅的女性身份能夠有效的影響這些孩子們的感情世界，更有利于他們忠于自己。
事實證明王雅辦的相當漂亮！他不僅給孩子們帶去了食物、衣物，還帶去了媽媽式的關心！兩三個月的時間，就有大一點兒的女孩子提出要求，想轉職為王雅的護衛。而且根據侍衛們反饋，王雅每次出現都會受到熱烈的歡迎！甚至在某種程度上比劉佩更受歡迎！
劉佩就像一個嚴厲的爸爸，他關愛孩子們，但絕不溺愛，甚至為了讓他們成才還給他們沉重的壓力。而王雅的母親形象則契合了這些孤兒心中最柔軟的地方，所以相當受歡迎！劉佩在私下里和王雅開玩笑說道︰「這些孩子總喜歡你的人比喜歡我的人多！」
劉佩帶著王雅在山東考察之後終于放下心來。這次秋收是成功的！根據賬房先生的統計，這次秋收之後，劉佩能儲備下足夠治下所有人吃一年的糧食！
而且，賬房先生們樂觀的預測，明年的秋收會更好！因為明年琉球和山東新開荒的土地都會有產出。這讓劉佩徹底放下心來，有了底氣進行更大規模的戰事。
隨著時間的推移，海上的火藥味兒越來越大。劉佩和鄭芝龍雙方已經多次在海上大打出手。雖然沒有上升到戰爭階段，但是已經讓人嗅到了海風中的血腥氣息。大家都在等著這場最後決戰的發生。這次戰斗將決定這片大洋的歸屬。
在外海的一個海島上，有一個海盜的寨子。寨子很破舊，能看得出它經歷過很久的時日，應該是海盜們駐扎很久的老巢。在最中間院子里，鄭芝龍正七八個人邊喝酒邊開會。參會的人大部分就是日後大名鼎鼎的十八芝成員。只是此時十八芝還沒有正是成立。
幾個人剛剛討論完船隊保養和補給的情況，鄭芝龍放下筷子，認真的說道︰「大瑄，紅眼蛇手下船隊大致的數量模清楚了嗎？」
鄭芝龍口中的大瑄是指施大瑄。也是未來十八芝的成員。他本人不起眼，但是他有個厲害兒子，就是施瑯！
施大瑄說道︰「大致模清楚了！這段時間里他們不斷地在挑起事端，我們都忍了下來！只是他們恐怕想不到，我們只是想通過交手模清楚他們的底細！他們若是知道了，只怕腸子都得都悔青了！」
在座的眾人大笑起來，鄭芝龍也跟著微笑。說道︰「那麼再開戰的話，他大致能觸動多少船？」
施大瑄說道︰「大致在30條左右。但是我猜測，這些船肯定不是他全部的船隊。他肯定還有後手！」
施大瑄身旁的洪旭卻接過話頭。這洪旭也是一條好漢！他起初跟隨鄭芝龍一起被大明招降，為明總兵官鄭芝龍的部將。順治二年(1645年)由隆武帝朱聿鍵晉封為忠振伯。順治三年(1646年)鄭芝龍降清後他歸依鄭成功，舉義抗清。
順治十一年(1655年)鄭成功承制設六官，以洪旭為戶官，旋改任水師右軍、水師總督，會中提督甘輝取舟山。順治十五年(1658年)鄭成功北伐，以洪旭兼理兵官，同黃廷、鄭泰一起留守金廈。順治十七年(1660年)清軍攻打廈門，鄭成功與洪旭大破清軍。
順治十八年(1661年)鄭成功率軍東征台灣，命洪旭輔佐世子鄭經留守思明。康熙元年(1662年)五月鄭成功逝世後洪旭請鄭經率兵渡台靖難。在東渡台灣之後，洪旭建議鄭經設置軍隊駐守澎湖，並且訓練軍隊，加強台灣防衛。並且派遣商船到達日本和東南亞地區通商。康熙五年(1666年)八月，洪旭因為憂勞過度染寒疾逝世。
洪旭大笑著說道︰「如果是我，我也不會將全部的船隊放出來！我估計他手里大約是40條船左右。像海楸之類的小船我就沒算計。那種船打起仗來也沒什麼用。」
鄭志龍皺了皺眉頭說道︰「海楸也不是沒用，選好地方還是很有用的！另外他的水手們本事怎麼樣？「
施大瑄正色說道︰「挺不錯的！不像是新手！不過听口音全是北方人的口音，什麼時候北方人也這麼厲害了？都說被人善馬，南人善船，可是這幫北佬使船使得很不錯！就是海上接戰他們還不行！沒咱們的人利索！」
鄭芝龍說道︰「那就集中力量打肉搏戰！只要我們的人能沖上去，勝利就屬于我們的！」
一個長了一雙濃眉的大漢放下手里茶杯。此人名叫甘輝，也是一股海盜的頭目，和鄭芝龍走的比較近。此人也是一名英雄好漢！更難得的是，此人武藝高強，水陸皆能！而且心智極高，有料敵于先的能力！
甘輝是明末清初海澄縣(今屬福建省龍海市)東園村下房人。父母早喪，家貧如洗。為人重義任俠，好打抱不平，因此遭族長迫害，流浪于漳州、石碼、海澄等地，不敢久居鄉里。
1646年(隆武二年)，鄭成功在南澳起兵反清，招軍買馬;甘輝投入鄭軍帳中，以驍勇善戰馳名行伍間。1648年(永歷二年)四月，鄭軍攻同安，甘輝出頭陣，即斬清守備王廷于馬下。守將祁光秋、廉郎及知縣張效齡乘夜潛逃。拂曉，居民開城門迎鄭軍。