張煌言要「十三家兵」出征，「使之擾湖廣」清軍，牽制敵人，「以緩雲南」，挽救永歷政權即將覆亡的軍事危局。
但「十三家兵」終因兵力「衰疲」，加之勢單力薄，而未能出戰
康熙元年（永歷十六年、1662年），張煌言又將義軍移駐沙堤。
其時，鄭成功收復台灣後，建立鄭氏政權。
而魯王則身居金門，故鄭成功對其衣食供奉「禮數日薄」。
張煌言雖對魯王仍忠心不貳，且「歲時供億」不絕，但又「慮成功疑」，故「十年不敢入謁」魯王。
待到張煌言「及聞桂王敗亡」後，便「上啟魯王，將奉以號召」。
但沒有得到鄭成功的支持。
五月，鄭成功突然病逝于台灣，致使抗清斗爭形勢更為嚴峻。
張煌言則轉戰于寧海臨門村一帶。
這時，清廷浙江總督趙廷臣趁張煌言義軍處境艱難之際，再次寫信招降，張煌言不為所動，並回信拒絕。
十一月，魯王薨于金門。于是，張煌言只得轉戰于寧海縣臨門村一帶。
還師臨門，更使張煌言感慨萬千。
這時，清廷浙江總督趙廷臣乘張煌言義軍處境艱難之際，再次寫信招降，張煌言不為所動，仍然回信拒絕。
義軍此時雖多次奮戰，然孤懸海上，被迫孤軍作戰，日漸勢單力薄。
為此有人提議將義軍隊伍拉上雞籠島駐扎，張煌言認為此議不可行，雞籠小島，四面環海，易攻難守，若遭致清軍突襲有全軍覆沒的危險。
康熙三年（1664年）六月，張煌言見復明無望，在南田的懸嶴島解散義軍，隱居海島不出。
七月十七日，清軍通過叛徒找到張煌言隱居地，夜半渡島，張煌言同部屬羅子木侍僮楊冠玉等人被執。
九月七日，張煌言被清軍殺害于杭州弼教坊。
當他赴刑場時，大義凜然，面無懼色，抬頭舉目望見吳山，嘆息道︰
「大好江山，可惜淪于腥羶！」
就義前，賦《絕命詩》一首，臨刑時，他拒絕跪而受戮，「坐而受刃」，時年僅四十五歲。
監斬官見楊冠玉年幼，有心為他開月兌。
楊冠玉卻斷然拒絕道︰「張公為國，死于忠；我願為張公，死于義。要殺便殺，不必多言。」
言罷跪在張煌言面前引頸受刑。
張煌言死後由鄞縣萬斯大等人與和尚超直收尸，並由張煌言外甥朱湘玉到總督衙門買回首級殯斂。
並遵照他在《入武林》詩品所表示的願望，把他葬于杭州南屏山北麓荔枝峰下。
張煌言便成為與岳飛、于謙一同埋葬在杭州的第三位英雄，後人稱之為「西湖三杰」。
生前的友人葉振名登越王嶺遙祭忠魂，撰祭文將張煌言與羅綸二人並稱為「張司馬二客」。
清國史館為其立傳，《明史》有傳。
乾隆四十一年（1776年）清高宗命錄前朝「殉節諸臣」，並加以褒謚和祭祀。
收入《欽定勝朝殉節諸臣錄》。
清廷對張煌言加謚「忠烈」，且將其牌位入「祀忠義祠」，得享定期供祭。
其實張煌言今年也就25歲，都是大明年輕一代將軍。
不要說現在大明除了召喚大將外沒有多少猛人。
鄭成功，張煌言，張明振，李定國，閻應元，夏完淳，施瑯，李來亨，李岩，還有嶺南三忠等等。
現在沒有一個超三十歲，個個年富力強全是正當打之年。
皇家海軍和陸軍學院還有很多年輕後備青年才俊在培訓。
加大人才儲備和培養，又有領先世界的科技和先進火器。
現在大明可是毫不客氣的說，中國所有朝代中最強大的，無論是戰力還是經濟。
題外話說了這麼多，回歸正題。
看到一萬日本人蜂蛹到山坡下開始向上攀爬，林峰實在忍不住了。
但作為龍旗特戰隊軍官，他不會違反軍規擅自行動，而是不停向張煌言請戰︰
「都督，快傳令打吧，我們居高臨下直接能把手榴彈扔到一百米開外……」
張煌言看看海軍陸戰隊和小日本的距離，抬頭看看如熱鍋上螞蟻的林峰問道︰
「牛逼，你扔一個百米手榴彈給我看看。」
「啊……都督你說真的？」
听到都督讓他扔一個，林峰反而有些發愣。
張煌言點點頭︰
「軍中無戲言！」
可能是幸福來的太突然，林峰居然有些嗦起來︰
「都督，那俺真的扔了？」
「你還是男人嗎？這麼嗦！」
張煌言有些不耐煩，臉色往下一沉，林峰急忙抓起一顆手榴彈。
「快些爬，只要沖上去就是勝利，將軍說了，銀子大大有……」
柳生流弊的大徒弟，番頭華翔伊藤不停催促小日本快速爬坡。
「嗖……」
突然一個東西從山坡上扔下來，剛好砸在他身邊一個士兵腦袋上。
「 ……」
那東西都是鐵，還帶著一個木柄，因為速度太快，直接把那士兵腦袋砸的稀爛。
「什麼東西……」
華翔伊藤大吃一驚，急忙後撤一步低頭看去。
「轟隆……」
手榴彈突然發生爆炸，華翔伊藤和身旁幾個士兵直接被炸飛，落地之時已經城了殘缺的尸體。
「快，明狗發現了我們，全體沖鋒！」
柳生流弊見勢不妙，急忙傳令快速進攻。
「沖呀！殺呀！殺光明狗……」
「都督怎麼樣，根本不止八十米……」
扔出手榴彈後，林峰開心的咧開大嘴傻笑。
張煌言不在理會林峰，而是抓起一桿線膛槍傳令︰
「開火，給本都督狠狠揍這群小日本……」
「砰……」
命令下達的同時，張煌言抬手擊斃一個日本軍官。
「打……」
「砰砰……」
三千桿線膛槍立即輪番開火，密集的米尼彈如雨點般射向山坡下的小日本。
爬在前面的小日本紛紛被米尼彈擊穿身體或者打爆腦袋。
看到海軍陸戰隊突然開槍射擊，林峰立即來了精神。
他伸手抓起兩顆手榴彈就扔向山坡下日本人集中的地方，嘴里也沒有忘記下令︰
「兄弟們，剛才不是還在叫憋死了嗎？現在理會來了，使勁給老子扔！」
「嗖嗖嗖……」
「 ……」
龍旗軍兩百名手榴彈投擲隊，海軍陸戰隊也有一百名手榴彈投擲隊。
三百人不停使勁往山坡下的人群中狂扔手榴彈。
幾百顆手榴彈剛在日本人群中爆炸，接著又是幾百顆手榴彈飛來，只炸的小日本血肉模糊殘肢亂飛。