皇帝大婚絕不是洞房完就結束的。次日為皇後朝見兩宮日，朱翊鈞和莊靜嘉兩個克服睡懶覺的沖動，早早起來，按照禮制穿婚禮吉服拜見兩宮。
因李太後已經還宮，不再有秉政太後的身份，按禮應在陳太後之後接受朝見。朱翊鈞此前在審視整個婚禮流程的時候，因怕李太後心中失落，就請陳太後擔待些，打算今日先拜李太後。
陳太後本就是與世無爭的性子，朱翊鈞說了心中所想，陳太後無可無不可，就點頭同意。隨即朱翊鈞又安排人回稟慈聖，慈聖卻堅決拒絕——于是朱翊鈞最終還是攜皇後先到了慈慶宮。
左右宮人引帝後到了慈慶宮後，陳太後滿面春風，冠服升座。朱翊鈞穿越以來，除了陳太後生日接受朝賀之時，很少見她穿的如此隆重。
太後升座後，慈慶宮正門大開，宮人捧著裝有脩的盤子立于太後左側。所謂脩乃所記「蚳醢」也，就是用蟻卵加工成的蟻卵醬，供「天子饋食」和「祭禮」之用，也是席上佳肴。
內官贊禮，朱翊鈞與皇後在宮門外四拜。執事二人舉案至慈慶宮殿前正中。陳太後滿臉笑容，溫言叫起，召手叫莊靜嘉進入內殿，模著她的手低聲問話。
莊靜嘉臉色微紅，低聲回答了幾句什麼，朱翊鈞在殿外沒听清。陳太後身邊的司禮監掌印張宏低聲咳嗽，提醒陳太後此乃禮制所無。
陳太後橫了張宏一眼道︰「我們娘兩個說些體己，你咳嗽什麼？就知道磕頭禮拜，這人心都被你等弄冷了！」說的張宏站不住，跪下請罪。
陳太後又笑著對莊靜嘉道︰「莫要理他。這宮內雖然規矩大，也管不到你我頭上，以後多來吾這宮中走動，也要拖著皇帝來，莫讓他天天熬夜處理國事，累壞了身體。」
莊靜嘉低頭答應了。陳太後又問了皇帝對她可好？莊靜嘉明白太後意中所指，紅著臉回了個「好」字，如同蚊子哼哼一般。
陳太後又問莊靜嘉道︰「可會打麻將？說起來有趣，這麻將還是皇帝‘發明’，確實有趣！」
莊靜嘉搖頭回道︰「臣妾不會。」陳太後鼓動她趕緊學，張嘴又準備念麻將經。
朱翊鈞見不是頭，也破壞儀式進殿賠笑道︰「母後，兒子還要和新婦到慈寧宮，過兩天讓靜嘉專來拜見母後學這麻將。」陳太後這才放過了莊靜嘉。
隨後莊靜嘉跟著皇帝出殿，在內官贊禮聲中再拜。陳太後端容，示意身邊尚宮，將裝蚳醢的盤子端給莊靜嘉，莊靜嘉將之置于殿前案上，再拜。
內官贊禮道︰「禮畢！」朱翊鈞吐了口氣，又跟陳太後說了幾句話，就和莊靜嘉直奔慈寧宮。
慈寧宮外的儀式進行的簡短，李太後面上也帶著笑，受了帝、後二人的禮，她恪守禮制慣了的，沒有如陳太後那般出蛾子。
待這套禮儀完成，莊靜嘉返回坤寧宮，朱翊鈞則返回乾清宮處理奏章。
第三日為謝恩日，一大早朱翊鈞不再穿新婚禮服，而著皇帝冕服，皇後仍穿禮服，像昨天一樣，同詣兩宮前行八拜之禮。今日兩宮各自要把皇後叫進去說話——昨天陳太後讓皇後直接入內殿，的確違反了婚禮流程，但她提前讓皇後登堂入室，也算示好之舉。
隨後兩人返回乾清宮，朱翊鈞換下冕服，服皮弁服、升座。贊引女官引皇後，上前就拜位，向朱翊鈞行八拜禮畢。此拜之後，朱翊鈞和莊靜嘉之間新婚平等期結束，兩人此際在禮法上分了君臣——要不怎麼說皇帝叫孤家寡人呢，親老婆也就和他平等三天。
莊靜嘉拜完皇帝之後，大駕返回坤寧宮，服皇後冠冕服，升座。內官引潞王、公主等朱家親屬，向皇後行八拜禮，樂平公主也在其列。此拜之後，明示了潞王、公主和皇後之間的君臣分際，對他們來說，皇後是君，他們是臣。
隨後，一大早就進宮等在坤寧宮的莊靜嘉母親和妹妹，也就是朱翊鈞丈母娘、小姨子等親屬，向莊靜嘉行八拜禮。這照樣是用禮制把親情割斷，讓各自都明白君臣分野。
等莊靜嘉抓緊機會和母親、妹妹說完了話，女官引六尚等女官，進殿行八拜禮。之後引內廷各監局的內官內使、行八拜禮畢。這次拜見，是讓這些人認識皇後，從法理上明確皇後後宮之主的地位。
乾清宮朱翊鈞這頭，等皇後謝恩禮畢，就御奉天殿。頒詔布告中外︰「朕惟兩儀之位，承乾以坤邇者，聖母仁聖皇太後、聖母慈聖皇太後特諭，所司簡求令淑作配，朕躬仰遵。慈命謹昭告天地、宗廟，于萬歷五年三月九日冊立莊氏為皇後，正位中宮。以共承宗祀奉養兩宮，肇風化于九圍，綿本支于萬世。布告中外。咸使聞知。」
此詔頒布後，天下萬邦和臣民都知後宮有主，其為莊氏
此後的兩天，為受賀日和盥饋日。第四天一大早，文武百官具朝服上表慶賀。朱翊鈞具袞冕御華蓋殿，親王世子、大婚執事官等依次進殿行禮。隨後朱翊鈞升殿，導駕官前導，百官進表賀喜。
同日，皇後接受親王世子集體進內宮行慶賀八拜禮，外命婦進宮行八拜禮。兩宮太後也著禮服各自升殿、受內外命婦慶賀並接外命婦的賀表。
盥饋日是冗長的大婚禮儀最後一天，皇後要給天下兒媳婦如何伺候婆婆打個樣子︰清晨，尚膳監準備好行禮用的膳饈。皇後具禮服詣兩宮，傳膳。皇後至太後案前，四拜。尚食局女官以膳授皇後，皇後捧膳進于案，再四拜後退于太後西南方向侍立。等太後吃了幾口後，禮畢還宮
當皇後不容易，當太後的兒媳婦也不容易。莊靜嘉這些天如同木偶一般行禮、受禮，被皇宮內的禮儀給整的不會笑了都。幸虧皇帝每夜在坤寧宮的陪伴，讓她能好過些。
朱翊鈞作為現代人，生怕莊靜嘉小小年齡懷孕，因此並不是每日都和她魚水共歡，歡好之時也用些手段。莊靜嘉問起他為何這般，朱翊鈞就給她上一堂生理衛生課。
盡管兩人好的蜜里調油，等大婚結束，莊靜嘉還是被添堵了——皇帝奉兩宮之命下旨，冊封王氏喜姐為昭妃，楊氏名佳的為宜妃，令「禮部具儀擇日來聞」。
兩妃定下，隨後九嬪也就位，這些人和莊靜嘉的排場相比，天地之差，不過都是用一頂輿轎從皇城側門抬進來罷了。兩妃的冊封禮能復雜些，由國公、輔臣在謹身殿主持冊封，但和莊靜嘉享受的待遇相比，也不可以道里計。
盡管被冊封的妃、嬪要向皇後行禮，皇後在場的時候，她們只能站著侍奉，但莊皇後這心里還是像堵了一團棉花似的難受。更可氣的是，尚儀局此後每日要將各後妃名單進上，由皇後安排朱翊鈞晚上住宿的地方——這權力簡直有毒，莊靜嘉差點把牙齒咬碎了去。
但是，朱翊鈞身上的物件，還有個名字叫「歷史的臍帶」，莊靜嘉心里再堵得慌，也得裝出大度的樣子，不敢專寵。這方面朱翊鈞就比較講究了，除了在昭妃、宜妃兩處各住了一晚之外，其余所有時間，不管皇後如何安排，朱翊鈞都否決了，主動住在坤寧宮，這才讓莊靜嘉好受了些
隨著大婚塵埃落定，朱翊鈞將精力轉到政事方面。三月二十六日，朱翊鈞發出了親政後的第一道國是詔書︰「朕躬登基以來，孜孜求治，不敢不惕勵親政，勤以愛民。雖國計日豐，然仍不能濟澤天下。億兆子民，嗷嗷待哺之狀可憫；凡有災殃，傷民萬計而不能救也。朕撫茲斯民，寧不慚乎？然積漸日深，一時難返也。」
「祖宗建極以來，二百零九年矣！世異則事異，時移則勢移，良有以也，安可用一法而垂永世？今之為治，當以開創之勢治天下，不當以守成之勢治天下；當以海納百川之勢治天下，不當以一統垂裳之勢治天下！蓋開創則更新，良法可致治世；守成則率由舊章，老弊更積漸也。」
「治天下必審擇所以為治之道，然後運之措之。易曰︰‘日新，之謂盛德。’書曰︰‘人惟求舊，器惟求新’。中庸曰︰‘溫故而知新’。新舊者，固古今盛衰，興滅之大道存焉。為政、治政者，寧不深思乎？」
「朕今欲興革政治，承天意以開新治者。易曰︰‘乾元用九，天下文明’，此朕之志也。」
「而治政之道，首在得人。今吏部尚書、食伯爵雙祿、中級殿大學士張居正，凡百庶政皆已著手，計熟事定，舉必有功；協贊勤勞，凡富國、養民、教士、治兵、人才諸事，不待朕求而百事畢矣。通下情而合其眾力，慎左右而調護陰陽，元輔之才顯明也。
由是特詔︰即日加張居正「內閣總理大臣」餃，以賞其勤勞恪職，起衰振隳之功；明朕之興革政治，創新求治之意。雖然懋賞，但示朕躬惓惓懇切、拳拳服膺也——令該大臣勿辭！」