隨著馮保在內廷影響力的消退，張居正會同葛守禮、朱希孝、陳矩等朝廷大員，就王大臣案終于有了會審結果。
朱翊鈞當時並未掌權，等他將王大臣轉至錦衣衛關押時已經晚了，王大臣被喂了啞藥，後續究問已經難以進行。
張居正在獲得李太後和朱翊鈞首肯後，在正式奏章中，對本案的關鍵人物馮保家奴辛儒的失蹤隱去不奏。只奏說王大臣身懷利刃，直入宮廷，謀擬之心已昭，結案並判斬首。
張居正在奏章中說︰「宮廷之內，侍衛嚴謹，若非平素曾行之人，豈能直面君上。」又說︰「望皇上敕下司禮監官，遵照律令嚴行申飭，有犯令者，必罪勿貸。」
司禮監批紅道︰「如卿等議行。著司禮監眾官嚴實宮禁。若有不按祖宗律令，懈怠慢法者，查實究罪。」
朱翊鈞則另起一行寫到︰「京畿首善之區，必政肅風清，乃可使四方觀化。」
「朕近覽錦衣衛奏報，經年以來，京師人心怠玩、法紀廢弛，置四方無籍之人潛藏，不法之徒多有。稱「大俠」者，以武犯禁，卻多稱善者而官府不問；稱「會首」者，團聚群氓，斷訟理事，宛然縣官也！」
「著兵部都察院並輯事衙門督率巡捕、巡視、順天府等官，施行嚴打。京師地面，流氓、地痞乃至城狐社鼠之流，一體緝拿，都問罪究治。嚴打期間，有以權涉法，干預訟事的，刑部必舉都察院查實奏來。各部府官再有懈怠嘻玩，誤公事者，也都一體治罪不饒。」
旨意頒下，兵部和順天府都上了謝罪奏章。朱翊鈞請示了李太後之後才批到︰「知道了，且戴罪圖功。」
隨著詔旨頒行，兵部、刑部、順天府和大興、宛平等二十余縣投入到熱火朝天的嚴打行動之中。一時之間，舊案翻起，新案窮追，觸目驚心。京師地面的「扛把子」、「混街龍」紛紛偃旗息鼓，錦衣衛、東廠等頭也趁機拉攏人才，擴充勢力。
不到兩個月，嚴打成效斐然，那沒大背景還敢作惡的或有大背景但罪大惡極的抓了不少，各監獄人滿為患，京師地面為之一靖。
大理寺諸官見案件卷宗堆積如山，不免各處訴苦。一次張居正在皇帝日講時，把大理寺的訴苦當頌聖的話兒講了。朱翊鈞寫了六個字給張老先生道︰「讓大理寺按這原則審。」
張居正見紙條上寫︰「從嚴、從重、從快」，苦笑道︰「難免冤獄也。」
朱翊鈞道︰「不然，可以試行民意決獄。將那人犯都綁了游街，被唾罵者多的，重判。同情善待者多的，遠流。」
張居正听了心中一震，他伺候三朝帝王，最近這五六年，更能常近天顏。可是從隆慶帝身上，卻從未如此明顯的體會到帝王和臣子之間的思路差異。
從朱翊鈞角度看，如此處事也與後世自己的理念不符。但還是那句話，決定腦袋，在帝王之位上坐了幾個月，他的言行逐漸向帝王方面轉變，不足為奇。
京師百姓可是見了西洋景了。進入夏天以來，京師內有帶大牌子被綁了游街的；罪大惡極，決不待時到西市吃刀的；有被打板子的；還有些高端的熱鬧——如女子被去衣杖刑的。
京師的老少閑漢上午去看游行，午時去看殺頭，下午去衙門看杖刑，如同趕場一般，飯都顧不上吃。
京師之人最是愛褒貶國家大事，也有消息渠道，不免將皇帝之嚴打政策拿出來討論。
有的就道︰「俺大舅子的五姨媽家里的丫頭在楊老大人府上做針線。听楊老先生說，此番皇帝被元輔攛掇，下聖旨說——
見邊上的人都伸長了脖子看向自己，這位得意道︰「若有犯過的，俱都殺頭；若有奸婬、人命等事，俱都剮。是太後慈悲，這才勸住。」
這听的道︰「皇帝小小年紀，心卻狠也！」
沒想到旁邊一聲斷喝︰「狗囊的住嘴！要我說，這北京城里該殺殺、管管了——你老姨家二扁頭流遼東了罷，回不來才好哩！」
「你不就是被二扁頭打了兩個嘴巴子嗎？留點口德罷！」
「再說，再說，就去衙門告你和二扁頭一伙兒的！」
話不投機，不免打在一處，夏天陽光下塵土飛揚，雙方都滿頭大汗，邊上圍了一圈兒叫好的
京師嚴打的消息傳至天下，有些地方官就有樣學樣。
每日都有分布在兩京各省的錦衣衛情報報至京師，匯總在錦衣衛總部的情報研究室，專由情報熟手做成內政專報送到朱翊鈞處。
朱翊鈞覽奏時，將施行嚴打的地方官姓名都細細記了，待以後提拔使用；把沒跟著自己政策走的名字也細細記了，預備有機會就廢黜幾個。
此日覽奏，錦衣衛報總督王崇古在宣大、山西大張旗鼓的開展「治平安，抓私易」活動，聲效斐然。朱翊鈞對王崇古有點印象，但不太了解其人，起先見他在奏疏里要經文、僧人，知道他至少在民族政策上是個明白人
而此時，這個明白人正在和稱病回家的外甥進行密室之談。
時人尤其是高官顯爵者在家里所設的秘密會談所在，或者是四面寥廓無法有人潛藏的場所——如張居正的書房。也有的在花園假山之間設計密道，以心月復僕人把守，談話人在不透音的密室中談話——如王崇古總督府的花園密室，此密室也可做他用，卻不宜細講。
雖是密室，但其間裝飾奢華，令人瞠乎其後。此番密談二人一個是宣大總督王崇古，一個是吏部左侍郎兼翰林學士張四維。
張四維父親是鹽商、外公經營漆器兼做軍糧運輸，都是家資巨萬的大商賈。其姑父、姨夫、二弟的岳父、五弟的兩任岳父，都是山西著名的巨富。
而其舅舅王崇古是宣大總督、其同鄉兼兒女親家是吏部尚書楊博。由此，圍繞著張四維，形成了後世鼎鼎大名的官商集團。
張四維和高拱關系不錯，也通過身後龐大的財力獲得了高拱的首肯，提拔他不遺余力。去年高拱被張居正和馮保聯手驅逐回了老家，張四維焉能立于危牆之下？立即報了病假，回老家蒲州讀書去了。
此時的密室之中，發生的甥舅二人的對話，卻是駭人听聞的。因為說話的人，秉承了他們血脈中優良的商人基因，看問題是極其現實的。
張四維先問自家舅舅，問︰「依舅舅看，這大明國祚還能有多少年？」
王崇古道︰「依我之見，若無商鞅、管仲那樣的人物，殆五十年而已！若有非常之變，不過二三十年！」