前田玄以在岐阜城中被自己身邊的小姓海保刺殺，凶手拿的是葡萄牙制的轉輪鐵炮。待前田家的眾將一擁而上要擒獲他時，海保又對著自己腦門上來了一槍。
待前田家想要把海保家父母兄弟全抓起來時，卻發現早已人去屋空。可見三法師的死亡和前田的遇刺，是織田家的敵人早就布下的暗手。這伙敵人提前得知了本能寺之變，刺殺三法師和前田玄以，就是要織田家進一步分崩離析。
天正十年六月初二的本能寺之變，令得到消息的大名們目瞪口呆。第一個得到消息的恰是正在高松城與毛利軍作戰的豐臣秀吉——當時他剛洗完澡，正在掏耳朵里的水。
在竹中重治死後，成為秀吉手下第一謀臣的黑田孝高踏進大帳，屏退眾人附耳秀吉道︰「明智光秀前天在本能寺襲殺了信長公——昨天又在妙覺寺圍殺了信忠殿下。」
豐臣秀吉驚訝的張大嘴出不了聲，掏耳朵的棉棒差點懟到腦仁里。黑田孝高很快就交代了情報來源︰是明智光秀派來聯絡毛利軍的使者，因高松城被四面圍困而誤闖秀吉大營。他看了明智光秀給清水宗治的信件，可以確認是光秀的筆跡。
豐臣秀吉在黑田官兵衛跟前不用裝，先呲牙咧嘴抽了一陣涼氣。隨即問道︰「一定是真的嗎？」
黑田早已通盤想透，立即建言道︰「不管真假，高松城急切難下。何不與毛利家講和？我們只取清水宗治的人頭即撤兵。如果消息是假的，清水宗治的人頭也足以給信長公交代；如果是真的——」
黑田如水靜靜的說出了原時空日本戰國史上那句著名的話︰「在這世間，只有主公才擁有取得天下大權的能力。」
這樣的建議秀吉沒有不采納的道理。于是立即同意了毛利軍的交涉請求——吉川元春和小早川隆景這兩位毛利軍的最高指揮本就害怕信長帶兵到高松與之合戰，于是同意以清水宗治和他的哥哥剖月復為代價，換取秀吉撤兵。
憑借黑田孝高建議的秘不發喪，豐臣秀吉臨走還佔了吉川元春一個大便宜。秀吉撤兵的次日，吉川元春也得到了織田信長被殺的消息，氣的險些暴走，本欲追趕秀吉，被小早川隆景拉住了——因為殿後的，正是黑田孝高，兩人都沒有追殺他的勇氣。
黑田孝高策劃的此次撤兵行動，原時空的日本戰國史上有個名堂，叫做「中國大返」。在本時空照樣發生，但正如前田玄以提前死了二十年一樣，在穿越者的時空是存在bug的。
天正十年六月初九，黑田官兵衛孝高在即將追上秀吉返回姬路城的時候，在城外道路上被潛伏的刺客一槍擊中前胸，身受重傷。刺客一擊遠，秀吉軍竟然沒有抓到行刺的凶手。
同日，三法師遇難和前田玄以被刺的消息也傳入姬路城，豐臣秀吉倒吸一口涼氣——這一環扣一環的，很有明智光秀的風範！
因為黑田孝高沒能參加六月十三日討伐明智光秀的山崎之戰，豐臣秀吉在佔領大寶寺這一要點上出現了重大失誤——竟然被明智光秀以一萬五千兵馬擊潰。
雖然次日再次聚兵拿下大寶寺，但得到喘息機會的明智光秀得以帶領近萬殘兵逃竄到了龍勝寺。
等豐臣秀吉圍困龍勝寺的時候——德川家康、柴田勝家這兩大織田家的重要勢力也都圍了上來，原時空獨佔為信長公報仇大義的豐臣秀吉，此際在軍事和政治上都遭受了重大挫折。
而策劃這一切幕後黑手，終于得償所願，後織田信長時代經過他的撥弄，豐臣秀吉距離統一日本，一下子變得遙遙無期起來、
萬歷十年的中元節那天，記錄織田信長死訊的情報傳到了朱翊鈞手中。朱翊鈞看過情報節略上短短的一句「明智光秀謀反，織田信長死于本能寺。」之後，長出了一口氣。
對于日本攻略，在第一征拿下緬甸之後，朱翊鈞判斷原時空的「猴子」未必會有那個膽子如期進攻朝鮮。蝴蝶翅膀已經煽動，他的目光自然也盯上了日本——在東西方貿易將中國變成「世界銀窖」之前，日本的白銀將是朱翊鈞設立金融體系重要一環。
日本島孤懸海外，現在內部如同養蠱一般，各方玩命廝殺。而織田信長在拿下武田氏之後，統一天下指日可待——朱翊鈞絕對不能允許日本在自己攻略它之前，出現統一的政權。他給軍情局的任務是︰「只做情報收集，絕對不允許干涉任何一方的勢力漲消。」生怕自己胡亂插手，導致「本能寺之變」不能如期發生。
因此，在得知翁大立和吳善言等輩向日本出口軍械之後，朱翊鈞的怒氣難遏。日本的軍械生意當然好做，但織田信長掌握著最大財力，向日本出口軍械只會加速織田信長對全日本的統一——這與朱翊鈞的日本攻略計劃背道而馳。
此時接到情報，織田信長如期喪生在本能寺，朱翊鈞放下心來。織田信長如期死亡後，才是大明插手的時候。于是，隨著本能寺之變的信息傳入，當日岐阜城就突燃大火，尚在襁褓中的織田信忠長子秀信和織田家的奉行前田玄以在混亂中被殺。
朱翊鈞拿起朱筆簽字前，看了看眼前在玩積木的洛郡王。幼名「三法師」的織田秀信比洛郡王還要小，卻被遠在中國京師的自己派人卑劣的暗殺——而接到這項任務的軍情局探子，甚至不知道總部為什麼要大費周章， 使用貴重的火油來岐阜城放火。
本能寺之變後，最能獲得織田部下擁戴的就是三法師。朱翊鈞這一手，直接將豐臣秀吉手中最大的砝碼打掉了。而狙擊手對黑田孝高的刺殺，導致了豐臣秀吉在山崎合戰中失去了應有的水準，與明智光秀打的難解難分不說，還被柴田勝家和德川家撿了現成。
織田信長死亡後，會帶給日本什麼樣的展開？而豐臣秀吉名望上升最快的山崎之戰，本時空終于被朱翊鈞給破壞的面目全非。豐臣秀吉會帶著池田恆興等人擁戴誰呢？剛斷女乃的織田秀則？還是和柴田勝家一樣，擁戴織田信孝？選擇很多啊，猴子和烏龜先生們！
朱翊鈞推演了一番，將手中卷宗喝上，笑著對莊靜嘉道︰「給放到東瀛的檔案里面吧。」莊靜嘉是做熟這項工作的，聞言將卷宗拿起，放在坤寧宮東暖閣的第一排書架上。
書架刷著黑色油漆，光可鑒人。每次莊靜嘉走到書架邊，看著上面掛著「西洋」、「南洋」、「歐羅巴」、「東瀛」等木牌，都要吐吐舌頭，同時對皇帝更加心折。