眾人是被一通電話給驚到了，第一時間返回東京的。
警察廳被人入侵了，各國間諜名單被盜走了。
安室透追擊那名入侵警察廳的女人，據說是酒廠員工，名字叫做庫拉索。
安室透追擊庫拉索，結果半道殺出個程咬金，fbi也參與了追擊庫拉索的行動。
兩方沒有通氣，沒有配合，這就導致哪一方也沒有抓到庫拉索。
庫拉索失蹤了。
諸伏景光一听到這話就坐不住了。
間諜名單泄露，安室透的身份也會暴露，以組織對付臥底的手段……
諸伏景光要第一時間趕回幼馴染的身邊，保護他，與他一同面對危險。
南野星樹叫來了直升飛機，乘坐直升飛機飛回東京。
此時是東京時間半夜兩點，萩原研二的義骸使用時間已經到了，靈魂月兌離了義骸。
不過他擔心安室透的危險，又向鬼燈請了兩天的假，留在現世幫助好友。
普通人都看不到他，他正好利用這個優勢進出一些私人場所和警察無法進入的地方，幫著他們找人。
柯南的身體是真的小孩子身體，因此一早就睡了。
南野星樹等人接到消息後沒有叫醒柯南，南野星樹更是給柯南嗅一下安神的花香，讓他睡得更熟，被抱上直升飛機都沒有蘇醒。
南野星樹將柯南安置在自家的客房中。
這件事情還是不要讓柯南知曉為好。
這是國家與黑衣組織的博弈，柯南參與不進去。
但他忘記了柯南的事故體質。
他不讓柯南知曉，柯南卻無意中參與了進去。
諸伏景光急匆匆地離開了，他要趕去幼馴染的身邊幫助幼馴染。
南野星樹打開電腦，讓諾亞二號幫忙尋找庫拉索的蹤跡。
這個小姐姐是個非常會躲藏的人，全城的監控幾乎都沒有拍攝到庫拉索的身影。
松田陣平開車跟著自己的幼馴染出去了。
幼馴染進入私人的地方找人，松田陣平在外面等待。
若是萩原研二真的找到了人，靈魂狀態下無法通知其他人，就得由松田陣平這個能看到幼馴染能跟幼馴染對話的原普通人、現不能算普通的家伙來通知其他人了。
這對幼馴染是最好的搭檔。
清晨，柯南從睡夢中醒來，發現自己的睡覺地點竟然換了。
這里……
哦，是星樹哥家的客房啊！
柯南放下心，推門走了出來。
「早安，星樹哥。」
「早。」南野星樹對柯南道，「早餐做好了，你帶著自己這份和阿笠博士灰原哀的份兒，去隔壁吃。」
「誒？星樹哥要急著出門嗎？」
「嗯，有緊急的事情要處理。」
「明白了。」
難怪自己一覺醒來從北海道的酒店換到了星樹哥家的客房。
這是發生了什麼要緊的大事，星樹哥連夜趕回來了吧？
是什麼大事呢？
柯南想知道。
但他明白南野星樹不會告訴他，他只能閉上嘴，等會兒讓博士幫自己調查。
柯南提著保溫盒去了阿笠博士家。
阿笠博士看到柯南手中的保溫盒，眼楮刷地就亮了。
便是灰原哀，也雙眼放光。
她迅速從柯南手中接過保溫盒，提著進了廚房。
灰原哀會做菜，但手藝也只是尋常。
在吃過南野星樹做過的菜後，她明白了什麼才是真正的美食，跟阿笠博士一樣，期待南野星樹有空的時候做些好吃的分享給他們。
同樣，他們也期待綠川光做的美食。
灰原哀打開保溫盒，里面裝的是白皙的椰汁糕、半透明的蝦餃、金黃色的蛋撻和造型可愛的女乃黃包，還有一份炒河粉。
漂亮的造型和濃郁的香氣讓灰原哀直吞口水。
華夏美食果然是全世界最好吃的美食。
灰原哀已經愛上了華夏美食，她專門買了一本華夏美食菜譜，有空就研究制做。
柯南剛要開口讓阿笠博士查查東京這兩天發生了什麼事情，博士就告訴他一個不好的消息。
「為了安撫被你拋下的三個孩子，我答應他們今天帶他們去東都水族館玩。正好你回來了，就跟我們一起去吧！」
不要啊！
他想參與星樹哥的大事件，不想陪著一群小孩子玩啊！
「我能不能不去啊，就說我還沒有從北海道回來。」
「呵呵。」身後兩聲冷笑打破了柯南這個奢望。
柯南癱在桌子上，就知道灰原哀這女人不會讓他好過的。
灰原哀將裝好食物的盤子擺在餐桌上，對阿笠博士道︰「博士，趕緊吃，不要理這家伙。」
美食當前，博士哪里顧得上其他，立刻埋頭吃了起來。
那速度……
桌上的美食肉眼可見地減少。
「臥槽！給我留點兒！」
柯南立刻加入搶食的隊伍中。
早餐完畢，挺著小肚子癱在沙發上不想動彈的柯南被前來阿笠博士家匯合的三個小學生堵個正著。
這下子，他是不想去也得去了。
小島元太一出，柯南根本逃不出他的魔爪。
柯南不甘不願地被揪著去了東都水族館。
南野星樹先去了一趟警視廳，然後又去了警察廳。
警察廳里面沒有亂起來，有桑原和彥坐鎮，警察廳的運作有條不紊。
南野星樹來到桑原和彥的辦公室，桑原和彥正好向下屬布置完任務。
「就知道你回來。」
桑原和彥知曉南野星樹的性格，他對自己認可的人只會非常好。
諸伏景光是南野星樹認可的人，安室透是諸伏景光的幼馴染，為了諸伏景光，南野星樹也會幫安室透。
桑原和彥將資料遞給諸伏景光。
其實不用這些資料，南野星樹也知道警察廳發生的事情，諾亞二號可是非常好用的。
現階段，沒有任何一項科技能夠趕得上諾亞方舟。
做為其復制體的諾亞二號，在網絡世界就是一個王者。
給自家哥哥面子，南野星樹沒有說出自己入侵了警察廳網絡的事情，低頭翻看起了資料。
一會兒，南野星樹抬起頭，對桑原和彥道。
「和彥哥，我懷疑庫拉索應該是是失憶了。」
桑原和彥︰「嗯？」
南野星樹︰「所以庫拉索沒有返回黑衣組織，我們要先找到她！」
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