拿下中都鳳陽的消息傳到南京令大明欣喜鼓舞，但鳳陽一戰同時也引來諸多非議，尤其是朱一貴在戰場上下令用火炮直接朝著蟻附百姓開火，最終導致鳳陽大崩潰，從而至百姓死傷無數。
為此，都察院眾御史聯名上書彈劾朱一貴，以行糾察之職，就連朝中其他官員也對此極為不滿，尤其是各部大小官員數十人各自上書朱怡成，彈劾朱一貴視百姓如草芥，殘暴狼性，要求召朱一貴回京，奪職下獄，嚴厲處置。
這些彈劾奏折堆的如同小山一般，可以說朱一貴此舉犯了眾怒，甚至有幾個鳳陽籍的官員還跑到宮門外磕頭泣血，聲聲切切，懇求朱怡成為鳳陽百姓做主。
對此，朱怡成把彈劾朱一貴的奏折全部留中，但同時取消了拿下鳳陽對朱一貴的犒賞，此外還給鳳陽發去了一份訓斥，狠狠在聖旨里把朱一貴臭罵一頓，奪了他總兵職降為副總兵，這才和了把稀泥，把這件事給強按下來。
朱怡成不是什麼都不懂的皇帝，作為中興之主，他也是帶兵打過仗的，尤其在事後朱一貴第一時間就送來了請罪折，奏折中詳細講述了當時的情況，同時主動自請處置。
在朱怡成看來，當時朱一貴的處置並無不當之舉，如果朱一貴那時候不這麼做，不僅明軍陣營會被清軍沖破，甚至還會給明軍帶來想象不到的損失。如果到那時，那麼別說拿下鳳陽城了，說不定明軍潰敗退回淮安，而清軍就會趁勢反擊，在江北還未全部安定的情況下，整個戰局就會朝著無法想象的狀態發生變化。
再者，一旦朱一貴臨陣退縮，主動撤退的話，那麼等于開了一個壞頭。要知道如今神州還未全復，清廷依舊佔據著大片地區，假如清軍以這種戰法就能逼迫明軍撤退從而贏得戰爭的話，那麼今後的仗就根本不用再打了，到時候把幾萬甚至十幾萬的老百姓拉上戰場，明軍投鼠忌器之下還打什麼仗？不如雙手把城池全還給清軍得了。
但道理歸道理，這種話朱怡成是萬萬不能直說的。畢竟，作為大明的皇帝，神州的百姓全都是大明的子明，大明是為了推翻滿清而讓天下百姓挺起腰桿不再做滿清的奴才，而做一個真正的明人的大明！
從一個詞來表達，那就是「政治」而已，同樣對此事眾官員的彈劾也並沒有錯，尤其是御史本就行糾察之職，在這種震動天下的事情面前，如果他們不彈劾反而失職。
所以歸根結底，這幾乎是一筆糊涂帳，最終也以糊涂而終結。說起來，虧也就虧了朱一貴一人，原本以他的功勞，加官進爵是顯而易見的，可是現在這事一出，不僅進爵是泡了湯，就連剛剛復職的總兵也又一次被降為副總兵，這短短不到三月的時間內連續起落兩次，也算是大明官場奇談了。
「大人，此次彈劾朱一貴，皇爺留中究竟是何意？我等是否還需繼續上書？」在工部尚書蔣瑾的府中，幾個京官坐成一行，而在上首的自然是主人蔣瑾。
「看來朱一貴聖眷憂在啊！」另一個官員嘆道︰「鳳陽一戰他幾乎捅破了天，皇爺還強行把他護了下來。」
「朱一貴如何能同他人相比？範兄別忘了他可是宗室。」另一官員在一旁冷笑道。
「如此看來，再次彈劾恐也無濟于事，蔣大人您說呢？」其中一個三品官員沉嚀片刻，轉而把目光投向了上首的蔣瑾。
蔣瑾端坐著，神色並沒什麼變化，只是靜靜看著眾人。在坐的人中有的是自己工部的親信，比如說最後說話的右侍郎，也有的是其他各部的中級官員，還有兩個官職雖然不高卻是御史，這一次眾人彈劾朱一貴鬧得沸沸揚揚，就連那幾個鳳陽籍的官員在宮門磕頭泣血，也是他們找來的，其目的就是要拉朱一貴下馬，給天下一個「交代」。
但沒想到，朱怡成強行按下了這件事，除了取消封賞，並且把朱一貴降為副總兵戴罪立功之外就再無其他處置了。這結果讓大家很是失望，為此這些人主動找到蔣瑾處討個主意。
當听到有人提起朱一貴是宗室身份的時候，蔣瑾心中不由得冷笑起來。旁人不清楚，他難道還不知道麼？作為大明重臣，尤其是自寧波就跟隨朱怡成的老人，蔣瑾自然清楚朱一貴這個所謂的宗室身份是打著引號的。
實際上，朱怡成並沒有直接宣布朱一貴宗室的身份，但因為朱怡成也未有否認所謂朱一貴宗室的身份，這才會給予許多人一種誤解。說白了，朱怡成這麼做，主要還是愛才惜才，同時從政治方面來考慮而已。畢竟前明滅亡後，大明宗室凋零，就連朱怡成一支也僅剩了他一人而已，在大明新復的情況下，為了平衡各方面的力量，尤其是對軍中進行更好的掌控，默許朱一貴頂著宗室的名領兵是有好處的。
何況，朱一貴的宗室名不副實，朱怡成隨時隨地也可以否定他的身份，並以此為罪名，這樣一來就等于死死捏著朱一貴的把柄，讓朱一貴成為朱怡成手中一把不錯的武器，而且從這些年的情況來看，這把武器也用的極是順手。
作為皇帝，權謀之術自然不是他人可以猜測的，也只有蔣瑾這樣的老人才會看得明白。說白了，這也是蔣瑾這一次主動拉幫結伙彈劾朱一貴的原因，如果說蔣瑾是出于為鳳陽死難者討個公道的目的話，恐怕蔣瑾自己都不相信。
蔣瑾又不是讀死書的呆子，兵事無常他會不知道？在那種情況下別說朱一貴了，假如他領軍的話同樣也會這麼做。而他只所以找人一起彈劾，因為他知道這樣做非但不會惹來朱怡成的怒火，相反還能用這種方式幫助朱怡成敲打一下朱一貴。
而事實的發展也正是如此，朱怡成最終按下了此事，對朱一貴也是一番敲打和責罰。從這點來看，蔣瑾的判斷一點都沒錯，而他也達到了自己所要的目的。