南京作為大明曾經的兩京，其皇城一直存在，在後世南京故宮更是重要的旅游景點。
清廷入關後渡江佔據南京，改南京為江寧又稱金陵，對南京的皇城直接劃歸給了駐防八旗，也就是說皇城成是滿清八旗在南京的駐防地，江寧將軍和統領的衙門直接設在皇城之中，拿下南京後，朱怡成下了兩道命令，第一道命令就是復金陵（江寧府）為南京（應天府），而第二道命令就是把駐防在皇城的八旗全部清理出去，復皇城原來面目。
重改金陵為南京（應天府），這在朱怡成入城時候就完成了。至于恢復皇城本來面目這需要些時間，一方面居住在皇城中的八旗數量不少，雖然這些人大多並不是八旗士兵，只是普通家眷和老少，不過把這些人全部從皇城遷到別處看管沒些時日是不可能的。再者，由于南京失陷幾十年，如此多的八旗在皇城中駐防已給皇城原來的結構帶來了極大破壞，等這些人遷出後必須對皇城進行必要的修繕方可。
故此，入城後的朱怡成暫時把兩江總督府作為臨時居所入住其中，同時，拿下南京雖是重大勝利，可整個戰局還未完全結束，眼下除了蘇松的清軍還需解決外，更重要的還是在溫州苦戰的明軍。
「我大明威震四海，所向披靡，如今南京收復，臣為監國賀！監國萬歲萬萬歲！」
南京收復第二日，廖煥之就趕到了，見了朱怡成行參拜大禮，當朱怡成讓他起身後，廖煥之更是滿面笑容地從地上爬了起來。
拿下南京意味著什麼，廖煥之比任何人都清楚。如今南京在手，依托長江天險和水師的力量，江南半壁已基本在明軍手中。而蘇松的清軍在南京被攻陷後可以說是陷入絕境，其敗亡之是旦夕之間。
等解決了蘇松清軍，明軍就完全佔住了江蘇、浙江、台灣還有徽州以南大片地區，再加上其他義軍的控制區域，可以說明軍已完全具備了爭奪天下的實力。
現在，朱怡成雖然還是監國，但在廖煥之眼里朱怡成已有正式登基稱帝的資本了，而他作為朱怡成手下的第一文臣，到時候水漲船高那是自然的，別的不講，未來一個首輔穩穩當當。就算朱怡成暫時不設內閣，封侯拜相也是早晚的事，回想僅僅一年的時間，他廖煥之從一個毫不起眼的小小知縣到如今馳騁風雲的人物，這一切仿如夢中一般。
「廖先生，杭州現在情況如何？」
「請監國放心，杭州一應事務已安置完成，為臣北上前玉露兄所派的官吏也都已到位，其余各事井井有條……。」
朱怡成听了微微點頭，鄔思道雖一直在寧波未跟隨大軍北上，可在大軍北上和作戰時期，所有後勤和地方接手跟進工作全是鄔思道一手安排。明軍勢如破竹，先佔杭州，再佔南京，如沒有鄔思道在寧波進行後勤保障和資源調配，再加上對所佔地的官吏及時派遣和控制，朱怡成在前線也沒如此放心。
拿下南京，寧波的地位必然會有變化，等接下來掃平蘇松，再擊退藍理和年羹堯大軍後，明軍的政治中心就將從寧波逐漸轉移到南京。不過，對于寧波，朱怡成還是極其重視的，作為穩固的後方和重要商業港口，朱怡成準備把南京打造成政治和軍事中心，寧波轉為經濟和工商業中心，以此穩步發展。
廖煥之作為文官第一人，拿下南京後當然必須盡快趕到，何況南京是座巨城，接下來還有許多千頭萬緒的工作要廖煥之接手操辦，至于朱怡成他的目光還在蘇松，他要盡快解決蘇松的清軍。
同廖煥之聊了幾句，主要內容是如何穩定南京城，依托長江天險以防清軍南下，同時以南京為中心打造都城的一系列工作。廖煥之來前早有準備，對朱怡成提出的問題對答如流，令朱怡成很是滿意。
這次會見雙方足足談了一個多時辰，等要事談完，廖煥之又道︰「有件事臣要報監國。」
「何事？」
「臣來之前杭州來了一人，此人身份敏感，所以臣此次前來特意把他給帶到了南京。」
「身份敏感？此為何人？」朱怡成頓時好奇道。
「福建，陳五顯。」廖煥之回道。
「陳五顯？他還活著？」听到陳五顯的名字，朱怡成猛然一愣，緊接著有些驚喜。自藍理剿滅陳五顯部後，此人就下落不明，一直傳說他早就死在亂軍之中了，可誰想他居然還活著，不僅活著還從福建跑到了杭州，現在又被廖煥之帶到了南京。
雖說陳五顯曾被朱怡成封為「總兵」，可這個封賞說白了是權宜之計，也是朱怡成為了拉攏天下義軍，以展現自己大明正統的一個手段。實際上，朱怡成的明軍和陳五顯之間毫無瓜葛，雙方更未有直接聯系和統屬關系，陳五顯在福建起兵，朱怡成後來以監國名義封賞並承認其身份，主要還是利用陳五顯牽制住福建的清軍罷了。
這就和像同時封賞袁奇、祝建才等人的性質是一樣的，在朱怡成一系中，廖煥之作為文臣第一人當然知道其中的彎彎道道，所以當陳五顯從福建一路逃出最終自己找到杭州求見後，廖煥之雖然對此人客客氣氣，卻未向外人告知此事，甚至把這件事悄悄封鎖起來，這一回又把陳五顯暗中帶到南京，就是讓朱怡成親自決定如此處置。
「廖先生既然已見過陳五顯，你覺得此人如何？」想了想，朱怡成問道。
廖煥之微微一笑，回道︰「此人看起來倒是頗有幾分忠義，不過其性究竟如何，為臣無法決斷。」
「哈哈哈！孤明白了。」听到這，朱怡成頓時大笑起來，這廖煥之也是個滑頭，雖給陳五顯說好話卻又不肯擔風險。不過，听說陳五顯此人雖是普通出身，但起義後其部軍紀甚嚴，對百姓也是秋毫無犯，在當地口碑甚好。
對于陳五顯此人，朱怡成早就想見一見了，何況此人兵敗後又千里來投，就算最終無法重用，把這人掛個閑職養起來又如何？他作為堂堂大明監國，難道還容不下一個區區陳五顯？那也太小看他朱怡成的肚量了。
當即，朱怡成就讓廖煥之把陳五顯帶過來一見，當見到陳五顯後，朱怡成仔細打量著他，只見陳五顯身材普通，樣貌也沒什麼出眾，粗一看起來就和福建一平常農夫沒什麼太大區別，不過當他抬頭後發現這人的一對濃眉和一雙眼楮尤其明亮，而且從他的目光中看，此人的確頗有正氣。
同陳五顯聊了聊，的確如廖煥之所說陳五顯心有幾分忠義，對于清軍也有著深仇大恨，更重要的是對朱怡成顯得尤其尊敬和敬慕，還有一點是朱怡成比較滿意的，經他試探發現陳五顯此人沒有什麼太大的野心，他唯一所求的就是能夠光復漢人江山。
這樣一個有能力又無野心的名人，朱怡成當然不會放過，好生安撫了他幾句，不僅給予賞賜，就連之前所封的總兵餃這一次也正式給了他。但是直接帶兵暫時是不可能的，征求意見之後，陳五顯毫不遲疑地答應先在明軍中以副手之職負責軍紀、後勤等工作，至于其他並無所求。
這個結果可謂皆大歡喜，對于和陳五顯一起逃到杭州的另外幾個兄弟，朱怡成也大度的一並收下，同時進行封賞。
拿下南京，朱怡成已在著手對付蘇松的清軍了，而當南京攻下後的第三日，董大山部就對蘇州城展開了激烈的進攻，而且水師一部除留駐南京監控江北外，其余順江而下從鎮江、江陰兩地向南滲透，同時杭州的明軍也已往東北滲透，以防蘇松清軍向南突圍。
「師將軍！為何還不盡快出城擊破反賊？」蘇州城，張伯行此時此刻已沒了往日的儒雅，沖著坐在那邊一言不發的師懿德斥問道，在他看來如今這局面完全是師懿德沒有听他的意見，如果早些日子就先擊破正面松江的賊軍，然後趁賊子圍攻金陵的機會直撲寧波，那麼定能扭轉乾坤。
師懿德雙目無神，口中微微顫抖，現在這個結果其實他在最早就預料到了，只不過沒想到如此堅固的金陵城居然僅守了幾日就被賊軍攻破。
現在金陵丟了，北退的路完全斷絕，向東、向南、向西全是賊軍的地盤，而且賊軍已步步緊閉壓了過來。形勢危急，而他手中雖有數萬大軍，可僅只有常州、蘇州兩城，以兩座孤城要改變局面根本就是不可能的事。
「師懿德！老夫再問你一句，為何不盡快出兵！」見師懿德一直不說話，張伯行更是惱怒。
「夠了！」在一旁的錢大昌終于忍不住了，拍案而起就要大罵出口，虧他張伯行到現在還如此妄言，難道他就不知道造成這樣局面的不就是因為他的一意孤行麼？
「住嘴！」還沒等錢大昌罵出口，師懿德低喝了一聲，隨後見他緩緩站起了身……。