這個神秘的日記的主人，是一個俄裔的醫師，他的筆記會出現在這日本，恐怕是因為他為了找尋自己的女兒，應IAG國際救援組織聯盟邀請，來到災後的大阪地區。
後來，這位醫師主動參加了一個災害調查小組，意圖前往東京，打算找到自己女兒的下落。
這本日記的筆跡很潦草，不管是俄文還是寫得歪歪扭扭的日文，都是要認真猜才能夠判斷原文是什麼，特別是有些段路看了半天都猜不出來，實在是想要打人。
加入災害調查小組後，日記的前面數十頁紙，依舊是零零碎碎的日常記錄，內容不是日記主人發牢騷，就是寫一些沿途的遭遇。
這里的信息很多都是無用的，但也有一些細節值得推敲，支倉冬夜通過日記分析了這支災害調查小組的路程。
本來，從大孤到東京的路程最多不過五百公里左右，坐新干線只要花兩個小時，自駕也花不了一天時間，但是因為受災嚴重的關系，很多舊時的交通線無法通行，公路損毀嚴重，特別是很多區域路況糟糕，被廢棄的車輛殘骸堵死，鐵路交通方面就更不用說了。
災害調查小組必須步行繞遠路才能夠抵達，再者，他們並非是直達東京，而是打算從近畿的大阪出發，前往京都或是橫濱這幾座尚且沒有完全淪陷的城市調查完畢後，再轉道前往東京。
根據從醫師本人只言片語，淪陷日時，東京與世界上好幾個大城市是受災最嚴重的區域。
很多人認為東京應該已經沒有活人了，而是被各種在災後淪為大量奪心者和惡墮種的樂土。
但是關于淪陷日的很多細節，需要前往那里進行調查後才能夠得出明確的結論。
「果然，日記本上很早就提到過關于惡墮種的情報，另外，從筆記中的各種描述，奪心者應該就是我之前遇到的那些喪尸。」
——奪心者，是那個末日里最普遍，也是危險的存在，它們的來源不明，只是知道成為奪心者的人類，會變得類似電影中的喪尸那樣形容枯槁。
除此以外，它們會失去心智，淪為只遵循本能的怪物，進食和攻擊會變得極強。
當然，奪心者也有不同類型的差異，普通的奪心者缺乏智能，只會重復生前的某種執念般的行為，而一些上位奪心者具備一定程度的智力，而且會召集同類對人類發起進攻。
「上位奪心者，那麼這麼看來，我過去對上的都是些普通的奪心者……」
看到這里支倉冬夜搔了搔下巴，醒悟了這一點。
日記後面的內容，描述到了他們抵達了幾乎變成廢墟的京都，可是還沒有進入京都就遭遇到一只巨型化的惡墮種，迫于無奈，只好撤離出來。
災害調查小組沒能夠進入京都，只能半途改道，在這途中，他們險些陷入補給不足的危機，好在半路上遇到一群荒野上的游蕩團體，接收了對方的幫助。
這支團體是由一支車隊組成，而車隊的首領是個名為御船宏三郎的男人，他根據御船的自我介紹，御船宏三郎是隸屬于名為「神慈恩典大御教」的高級骨干，職位是座師，而這個收攏了不少荒野上的居無定所流浪者的車隊，也全都是信仰神慈教團教義的信眾。
當時，在日記里看到這里的他也愣了一下，因為「神慈恩典大御教」怎麼听上去與那個神慈恩啟教听上去很相近。
「不，也許只是名字相近的教團，因為這個御船宏三郎的行徑，還有這支車隊並不像是什麼邪惡教團中的一份子……」
他本來是這麼想的，不過接下來日記主人關于「神慈恩典大御教」的詳細說明，就使得支倉冬夜大為驚訝。
……日記的主人，那位俄籍醫師如此記述著，他在與御船宏三郎的接觸中，逐漸了解了不少關于神慈恩典大御教的情報，知道這個教團又名是「神慈恩啟教」，而且誕生于二戰發生前。
據說教主是個名為長尾美伎的女性，她是個有特殊能力的靈媒，有一天自稱受到了神啟，就建立了神慈恩啟教，因為當時正是日本國家神道擴張時期，明治政府為了打壓佛教和異己，提出了「廢佛毀釋」的理念，一方面對佛教進行打壓，頌布了神佛分離令，另一方面用以統一和整頓民間的宗教體系，強化當時的明治天皇的權威性。
神慈恩啟教做為新興宗教受到政府打壓，該教的初期發展過程中，受到許多嚴厲的迫害、阻擾，就連教主長尾美伎也因為屢次被憲兵的傳喚、拘留，蒙受了不少的苦難，最後因不堪其撓，選擇在獄中服毒自殺。
而教團則認為長尾美伎並沒有死，而是以「教祖為了拯救世間眾生之道，終于在明治二十年（1887年）農歷正月二十六日隱去了身影……」
在初代教祖死後，其他信眾又尊這位長尾美伎為「典範之母」。該教認為教祖所以隱去了身影，完全是為了急欲使父母神憐愛的子女成長的緣故。根據該教教理所示，該教認為教徒雖然看不到教祖的身影，長尾美伎卻已經登神，隱于神世之中拔濟眾生，守護信眾。
讀到這段的支倉冬夜簡直一頭霧水。
「……明治天皇，二次世界大戰，還有神慈恩啟教的這段歷史，這不太對勁吧？這該不會是我原來世界里的歷史吧？」
這個世界，可沒有什麼明治天皇，也沒有經歷過二次世界大戰，更何況這里說明的神慈恩啟教的歷史，與他所知曉現在的這個「神慈恩啟教」的歷史是全然不同的。
至少在這個世界里，神慈恩啟教的教祖名為「平賀唯心」，他可是個現代人，出身經歷都可以查出來，而除他建立的「神慈恩啟教」，日本國內並沒有與之同名的宗教。
支倉冬夜忍不住抓了抓頭皮，他心中可以說是問號連連，因為筆記中記錄的歷史細節，明顯不是自己所置身的這個世界的歷史，而更像是自己上一世的世界中的歷史。
「難道說末日副本不是發生在這個世界，而是我所在的那個世界，那麼我在這個副本世界中見到的貴宮祐希是怎麼一回事？不是她本人，而是類似于異時空同位體那樣的存在……」
一時間，他的心底思緒翻飛。