李淵在長安立穩根基之後，隨即派出數路兵馬經略關中，以確保長安城周邊的安全。
李世民被派往隴右，帶兵抵御隴右的薛舉。在扶風，李世民大破薛舉的前部十余萬兵力，斬首千余級，並乘勝追至隴山腳下。
薛舉攝于李世民的兵威，一度有投降唐軍之念，卻被心月復謀士郝瑗勸阻。
姜謨、竇軌被命從散關出兵，安撫隴右。他們二人進兵到長道，被薛舉打敗，帶兵歸來。
李淵的堂佷李孝恭被命招撫秦嶺以南。李孝恭在金州打敗反王朱粲，卻並沒有殺他。
李孝恭的懷柔之舉，引來了大批州縣的歸附。從此，從金州到巴蜀，檄文所到之處，幾乎全部歸附了李孝恭。
李淵寫信給故交河池太守蕭瑀，讓他前來長安任職，蕭瑀又說服了平涼留守張隆、漢陽郡前來歸附。
府戶曹張道源被派往山東經略。劉文靜帶兵向東，征服了弘農郡。太常卿鄭元壽率兵出商洛、經略南陽。左領軍府司馬馬元規經略荊州、襄陽。
待諸路兵馬就位以後，李淵即著手出兵東都，準備佔據洛陽城。
他派世子李建成為左元帥、秦公李世民為右元帥，領兵十余萬，向洛陽進發。
李建成領兵來到東都以後，發現李密也在派兵數十萬準備攻取東都，而且洛陽城內還有王世充帶來的江淮精銳數萬人。另外，叛賊宇文化及帶領十萬禁軍將要路過中原，到時候免不了要在中原惡戰一場。
此際，東都的形勢比較復雜。
李建成和李世民兄弟二人合計以後，認為此時即便是攻取東都，將會面對數倍于己的勁敵，未必能夠堅守。所以，不必浪費兵力。
他們就此上書父親李淵，講明利害。于是李淵命他們兄弟二人先撤兵回來，全力經略關中。等到時局有利之時，再做謀劃。
民為天下之本，民亦為軍之本。若要經略關中，首要在于安定關中的民心。
天下罹難已久，民心思定，首要任務在于解決民生大計。
民以食為天，食以田為本，田以水為命脈。在此意義上，誰控制了灌溉水源，誰就控制了糧食的生產。
為此，李淵下詔，命工部所有官員下鄉，督促地方興修水利、修葺舊渠。
得水利之便，八百里關中平原的沃土得以重新煥發生機。關中的糧倉開始豐滿了……
此外，為了保證關中地區的安定。李淵下詔建制關中十二軍，分關中為十二道，諸道均置軍府——驃騎府或車騎府，分別隸屬于十二軍。
十二軍各立軍號，以萬年道為參旗軍，長安道為鼓旗軍，富平道為玄戈軍，醴泉道為秉鉞軍，同州道為羽林軍，華州道為騎官軍，寧州道為折威軍，岐州道為平道軍，豳州道為招搖軍，西麟道為苑游軍，涇州道為天紀軍，宜州道為天節軍。每軍有將、副將各一人，以督耕戰。
十二軍戰時警戒和出戰，並且擔任保衛長安的任務；平時則擔任屯墾和維持長安附近和平穩定的任務。
此外，關中四塞的東潼關，西大散關，南武關，北蕭關；李淵都提拔了重要的將領帶兵鎮守。對關口也都加以修葺和加固處理。尤其是潼關，他特派當世名將屈突通作為守將，嚴防東邊的兵力來犯。
為了保證關中地區的和平穩定。李淵又對人事做出安排——太子李建成的主要任務就是和父皇一起坐鎮關中，處理政務；而秦王李世民和齊王李元吉的主要任務是帶兵出征，帶領軍隊。此時，李元吉尚年幼，出征作戰的任務實際上落在了秦王李世民一人身上。