木星磁層的範圍大而且結構復雜，在距離木星140萬～700萬千米之間的巨大空間都是木星的磁層。
而地球的磁層只在距地心5萬～7萬千米的範圍內。木星的五個大衛星，都被木星的磁層所屏蔽，使之免遭太陽風的襲擊。
地球周圍有條稱為範艾倫帶的輻射帶，木星周圍也有這樣的輻射帶。有科學家研究還發現木星背向太陽的一面有3萬千米長的北極光。由此看來，木星磁尾至少拖長到了6000萬千米以外。
木星的磁氣圈分布範圍比地球磁氣圈的範圍大上100多倍，是太陽系中最大的磁氣圈。由于太陽風和磁氣圈的作用木星也和地球一樣在極區有極光產生，強度約為地球的100倍。
木星的大紅斑位于南緯23°處，長2萬千米，寬1.1萬千米。探測器發現，大紅斑是一團激烈上升的氣流，呈深褐色。這個彩色的氣旋以逆時針方向轉動。
在大紅斑中心部分有個小顆粒，是大紅斑的核，其大小約幾百千米。這個核在周圍的反時針漩渦運動中維持不動。大紅斑的壽命很長，可維持幾百年或更久。早在1665年，意大利天文學家卡西尼就發現了它。大紅斑艷麗的紅色令人印象深刻，顏色似乎來自紅磷。
鵝蛋形物體的自轉是逆時針方向，周期大約是六天。大紅斑的維度是24000至40000千米×12000至14000千米。它的直徑大到可以容得下2至3顆地球。這個風暴的最大高度比周圍的雲層高出約8千米。
風暴通常都發生在巨行星大氣層的湍流內，木星也有白色和棕色的鵝蛋形風暴，但較小的那些風暴通常都不會被命名。白色的鵝蛋傾向于包含大氣層上層，相對較低溫的雲。棕色鵝蛋形是較溫暖和位于普通雲層。這種風暴持續的時間可以只有幾個小時，也可以長達數個世紀。
在1953年，米勒-尤里實驗證明了閃電和存在于原始地球大氣中的化合物組合可以形成有機物（包括氨基酸），可以作為生命的基石。這模擬的大氣成分為水、甲烷、氨和氫分子；所有的這些物質都在現今的木星大氣層中被發現。
木星的大氣層有強大的垂直空氣流動，運載這些化合物進入較低的地區。但在木星的內部有更高的溫度，會分解這些化學物，會妨礙類似地球生命的形成。
在木星，因為在木星的大氣層中只有少量的水，還有任何的固體表面都在深處壓力極大的地區，因此被認為不可能存在任何類似地球的生命。
在1976年，在航海家任務之前，曾經假設基于氨與水的生命可能在木星大氣層的上層進化。這一假設是基于地球的海洋態環境，頂層有簡單的光合作用浮游生物，低層的魚可以喂食這些生物，而肉食的海洋生物可以獵食這些魚。在木星的一些衛星，地表之下可能有海洋存在，導致這些衛星更可能有生物存在的猜測。
趙中遙現在就看著飛飛，給他講了一些關于木星的知識。
飛飛听了之後，對這個木星就有了更加深入的了解。但是關于火星的一些天文現象中，有一個天文現象是非常著名的。就是木星表面的一個巨大風暴眼——大紅斑。
說到木星，稍微有些天文知識的人，就會想到大紅斑。畢竟，只要我們用天文望遠鏡觀察木星的話，就一定能夠看到木星上面的大紅斑。
想到這里，飛飛就又看著趙中遙說道，‘老爸，那你能不能再給我們講一講關于木星大紅斑的知識。我還想要多了解一些關于木星這個大紅斑的知識。’
趙中遙听了飛飛的話，就說道，‘好，既然是這樣的話，我就再給你講一些關于木星大紅斑的知識吧！’
說完，趙中遙就又給一家人講了一些關于木星大紅斑的知識。
木星大紅斑是木星表面的特征性標志，是木星上最大的風暴氣旋，長約25000千米，上下跨度12000千米，每6個地球日按逆時針方向旋轉一周，經常卷起高達8千米的雲塔。自從17世紀天文學家首次觀測到此風暴，大紅斑至少已存在200到350年。它已經改變了顏色和形狀，但卻從來沒有完全消失過。
木星大氣層中的大紅斑是一團激烈的沿逆時針方向運動的下沉氣流，這個氣流物質中含有大量的紅磷化物，所以呈深褐色。
這個大紅斑的位置並不是固定不變的，而是在不斷地移動。木星的大紅斑大致位于南緯23°處，它的南北寬度經常保持在14000千米，東西方向上的長度在不同時期有所變化，最長時達40000千米左右，一般長度在20000～30000千米。
在大紅斑中心部分有個小顆粒，是大紅斑的核，其大小約幾百公里。這個核在周圍的反時針漩渦運動中維持不動。大紅斑的壽命很長，可維持幾百年或更長久。
根據觀測結果顯示，科學家發現木星大紅斑中紅色最明顯的區域印證了冷風暴系統內部存在熱核心的理論；而觀測圖像中風暴邊緣深色的線條顯示出風暴爆發所釋放出的氣體正在向星球的內部漫延。
意大利的天文學家卡西尼指出，大紅斑是木星大氣的形態，就像地球空中的雲彩。卡西尼利用這個大紅斑準確地測量出木星自轉的周期、人們還在觀測中發現，大紅斑的顏色有時很濃，有時較淡，淡得人們只能隱約看到它的輪廓。大紅斑在緯度方向上還有漂移運動，因此大紅斑不是固態的物質。
木星是太陽系中自轉速度最快的行星，這使大氣中的雲被拉成長條形狀，共形成了17條雲帶。雲帶中亮的部分稱作「帶」，暗的部分稱作「帶紋」。從探測器拍下的照片看，大氣中的雲劇烈翻轉，在翻騰的雲中有一個顯著的大紅斑。大紅斑乘著大氣中上升的氣流，沿逆時針方向大約6個地球日旋轉一周。