小村壽太郎將會談的結果傳回國內，日本政府的桂太郎內閣看了之後，都十分滿意，因為雙方己就合作的意向達成了一定的基礎，如果雙方能夠真的談成合作，將會令日本在與俄國的對抗中底氣大增。
而海外華人提出的條件，在日本政府看來也不是不能接受，而且海外華人提出這些要求，正說明海外華人確實有與日本合作的意響，如果海外華人什麼條件都不提，反到是有問題了。另外現在日本的首要目標是確保自己在朝鮮半島的利益。至于中國的東北地區，現在日本政府的精英們十分明白，英美德法各國是不會允許日本獨佔中國的東北地區的。因此如果擊敗了俄軍，日本也不打算搶佔中國的東北地區，而是確保自己在東北的駐軍和商業利益就夠了，這樣一來不僅海外華人沒有話說，還可以保證日本在中國東北地區的存在和影響力，然後再等待合適的時機。
現在的日本還沒有到舊時空里那麼全國瘋狂，下克上亂走的地步，雖然也有孤注一擲的賭國運行為，但也是建立在精心的策劃、安排的基礎上，並不是胡亂下注，這一方面是日本現在的實力還並不強，僅僅只是在7年前打敗了紙老虎的清廷，這一勝績固然可以提振日本全國的士氣民心，但精英層卻是知道，這一場勝利的說服力並不強，日本在世界上的地位只能免強擠身于二流強國的地位，和英法德俄相比，還有相當大的距離；而另一方面，明治維新時涌現出來的一批精英大部份都還在世，而這批人大多都有世界視野，並經歷了日本弱轉強的過程，又經歷了30年的軍政歷練，論戰略眼光，要遠遠超過他們的後輩。懂得有舍才能有所得，見好就收的道理。
雖然在有些時候，一部份日本軍人的嗓門很大，叫得很凶，恨不得打遍全世界，但那不過是政治叫價的手段，為了爭奪首相的寶座，這個時候日本軍人還是很有些自知之明的，甲午戰爭之後，俄法德三國干涉還遼，日本很快就服了軟，而軍方也都老實不說話，沒有人敢叫和俄法德三國開戰。
而海外華人提議雙方釆用密約的形式，日本政府協商之後，也認為可行，一來是日本和英國結盟，己經引起了俄國的警覺和強烈反彈，一下子就派了6艘戰列艦到遠東來，讓日本陡然覺得壓力山大，也見識到世界一流強國的強大實力，因此如軍日本再和海外華人公開結盟，還不知道俄國會有什麼更加強烈瘋狂的舉動來，就是提前發動戰也不是不可能的，但這個時候日本還沒有完全做好準備，還是不要過份刺激俄國為好。、
二來即然是密約，就是不能公開，而且公開了也可以不承認，這樣也就給了日本很大的活動余地，雖然日本不打算在戰後吞並中國東北，但如果條件允許，從中割一塊肉下來填填胃口，到也不錯。而且地點日本國內都己經想好了，就是遼東半島，在日本看來，這本來就是日本的地方，因此打敗俄國之後，順手將自己的地方再拿回來，是完全合理的。反正打敗了俄國，也就不需要海外華人了。
于是日本政府立刻下令小村壽太郎，立刻和海外華人進行正式會談，並且以私人名議和海外華人簽訂協議。
接到了國內的命令之後，小村壽太郎立刻和李三杰展開了正式談判，雙方經過了幾天的協商之後，終于達成了四項協議︰
一、日本與華東政府互相尊重各自的權益，華東政府承認日本在朝廷半島的特殊利益，而日本承認東北地區的主權屬于中國，並保證決不侵佔這些地區；
二、雙方在針對俄國方面的情報互享，在國際上互相支持，互相配合，並建立在重大行動之前，互相通報機制；
三、雙方中任何一方在受到俄國攻擊時，另一方將出兵參戰，而任何一方主動攻擊俄國時，需向另一方發出邀請時，另一方才可參戰；
四、本協約為秘密協約，雙方均不得對外泄漏，並可對外否認本協約。附︰由于日本與英國有同盟協議，因此本條不適用于英國。
日本政府收到協議的條款之後，都覺得十分滿意，前兩條是雙方的互相交易，重點是第三條，因為海外華人和俄國沒有直接接觸，因此俄國主動發動攻擊時，只能先進攻日本，有這一條日本心里就有底了；而如果日本主動攻擊俄國，則可以視戰場的情況而定，是否需要請海外華人出兵。
當然日本也不是別有想到，海外華人也可能有相似的想法，不過協議的執行，還是要看俱體的情況而定，但這對雙方都是平等的，關建還是看政府的外交周旋能力。
于是小村壽太郎在國內的指示下，和李三杰以私人的名議，簽議了一份被後代稱為李小密約的協議。
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小村壽太郎帶著簽好密約，趕回日本去匯報，而就在這時，又有人到訪青島，這次來的人是清廷新任的直隸總督袁世凱。
原來俄國違反了交收東三省條約，並且向清廷提出了苛刻的附加條件，同時又派駐清公使格爾思向清廷發出外交照會，希望清廷能夠答應俄國的條件，並且還發出威脅，如果清廷拒絕接受俄國的條件，俄國將拒不再執行交收東三省條約，同時還將再出兵攻佔己撤軍的地區，並再度進軍南進；而如果清廷接受俄國的條件，俄國不僅會如約繼續撤軍，而且還願意幫助清廷，如提供貸款，修建鐵路，對抗英日等國等。並且還私下里會見了一些清廷的官員，向他賄賂錢財，要求他們為俄國發聲。
于是也有人在朝廷中發聲，認為應該接受俄國的條件，雖然說這些條件確實苛刻了一些，但畢竟能夠收回東北，而如果拒絕俄國的條件，不僅是東北收不回來，而且俄國真的出兵開戰，那麼大清可就真的危險了。
但就在這時，英美日三國的公使也都紛紛向清廷發出外交照會，要求清廷拒絕接受俄國提出的條件，同時支持清廷要求俄國繼續履行交收東三省條約。
而這一下清廷就有些左右為難了，畢竟這兩邊都不能得罪，雖然大部份人都偏向于英美日這一邊，這一方面是由于英美日的國際形像要比俄國好一些，而且如果俄國繼續履行交收東三省條約當然是再好也不過了；但現在畢竟是俄國佔據著東北，一定賴著不走，清廷也拿他沒有辦法，雖然英美日說是支持清廷，但能支持到那一步，誰都不敢保證，老實說現在清廷是對那一國都不信任。
就在朝廷議論不決的時候，李鴻章建議，不妨派人去詢問海外華人，看看他們的態度，如果以後真的要和俄國開戰，清廷還只能依靠海外華人。
于是廷下旨，命直隸總督袁世凱去青島，和海外華人會見。而之所以把這個差事派給袁世凱，是因為清廷己經下旨，命袁世凱出兵，平定直隸南部的景廷賓、趙三多、李壯勇等拳匪余眾之亂，而由于這一次平亂的位置在直隸、山東、河南三省的交界處，因此有可能會將戰火引到山東省去，這就有必要和海外華人達成一定的同識，一方面是方便平亂剿匪；另一方面也是避免發生誤會。袁世凱正好可以隨便把這兩件事情一起都辦了。
在清廷從西安返回北京的途中，景廷賓、趙三多、李壯勇等人曾在半途伏擊清廷的隊伍，到是把慈禧嚇了一大跳；而這一次出擊，卻令景、趙、李等人的聲望大增，加上當時清廷急著回鑾，而到了北京之後，又需要一定時間的穩定，因此又拖了2、3個月沒有行動。這就給了他們充份的發展時間。
結果景、趙、李等人的勢力在這2、3個月里迅速的擴大，部眾己達到7萬余人，並席卷河北、河南、山西三者，20余個州府，清廷的河南巡撫張人駿、山西巡撫毓賢都曾兩次出兵征剿，但都被景廷賓、趙三多、李壯勇等人擊敗，現在他們己經攻佔了7個縣城、2個州城，一時聲勢到是頗為驚人。而清廷也不敢再輕視這股拳匪的余眾，于是慈禧親自拍板，命袁世凱率北洋新軍出擊，平定這次叛亂。
這時袁世凱練兵己有5年的時間，北洋新軍也從小站練兵的7千余人擴大到了2萬5千余人，在庚子國變期間，北洋新軍並沒有參戰，盡管廷己不再追究此事，但也頗一些受詬病，因此袁世凱也打算借這次平亂的機會，向清廷展示一下北洋新軍的戰斗力，不過首先要解決好和海外華人的關系，畢竟這一仗是在山東邊境進行，而且很有可能會波及到山東去，亂匪一但被打散了，可是四處亂跑的。
于是接到清廷的下令之後，袁世凱立刻將出兵的準備工作交給徐世昌、王士珍、段祺瑞等人完成，而自己則帶著馮國章、曹琨來到青島，和海外華人會面。